Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Atp2b3Q0VF55 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Atp2b3Q0VF55 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Atp2b3Q0VF55 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Atp2b3Q0VF55 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Atp2b3Q0VF55 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Atp2b3Q0VF55 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Atp2b3Q0VF55 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Atp2b3Q0VF55 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Atp2b3Q0VF55 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Atp2b3Q0VF55 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atp2b3Q0VF55 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atp2b3Q0VF55 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atp2b3Q0VF55 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atp2b3Q0VF55 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atp2b3Q0VF55 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atp2b3Q0VF55 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atp2b3Q0VF55 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Atp2b3Q0VF55 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atp2b3Q0VF55 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atp2b3Q0VF55 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atp2b3Q0VF55 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atp2b3Q0VF55 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atp2b3Q0VF55 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atp2b3Q0VF55 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atp2b3Q0VF55 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atp2b3Q0VF55 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atp2b3Q0VF55 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atp2b3Q0VF55 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atp2b3Q0VF55 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atp2b3Q0VF55 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atp2b3Q0VF55 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atp2b3Q0VF55 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Atp2b3Q0VF55 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Atp2b3Q0VF55 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Atp2b3Q0VF55 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Atp2b3Q0VF55 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Atp2b3Q0VF55 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Atp2b3Q0VF55 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Atp2b3Q0VF55 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Atp2b3Q0VF55 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Atp2b3Q0VF55 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Atp2b3Q0VF55 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Atp2b3Q0VF55 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Atp2b3Q0VF55 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Atp2b3Q0VF55 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atp2b3Q0VF55 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atp2b3Q0VF55 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atp2b3Q0VF55 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atp2b3Q0VF55 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atp2b3Q0VF55 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atp2b3Q0VF55 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atp2b3Q0VF55 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atp2b3Q0VF55 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atp2b3Q0VF55 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atp2b3Q0VF55 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Atp2b3Q0VF55 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Atp2b3Q0VF55 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Atp2b3Q0VF55 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Atp2b3Q0VF55 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Atp2b3Q0VF55 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Atp2b3Q0VF55 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Atp2b3Q0VF55 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Atp2b3Q0VF55 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Atp2b3Q0VF55 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Atp2b3Q0VF55 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Atp2b3Q0VF55 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Atp2b3Q0VF55 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Atp2b3Q0VF55 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Atp2b3Q0VF55 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Atp2b3Q0VF55 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Atp2b3Q0VF55 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Atp2b3Q0VF55 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Atp2b3Q0VF55 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Atp2b3Q0VF55 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atp2b3Q0VF55 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atp2b3Q0VF55 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atp2b3Q0VF55 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atp2b3Q0VF55 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atp2b3Q0VF55 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atp2b3Q0VF55 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atp2b3Q0VF55 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atp2b3Q0VF55 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atp2b3Q0VF55 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atp2b3Q0VF55 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atp2b3Q0VF55 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atp2b3Q0VF55 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atp2b3Q0VF55 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atp2b3Q0VF55 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atp2b3Q0VF55 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Atp2b3Q0VF55 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Atp2b3Q0VF55 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Atp2b3Q0VF55 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Atp2b3Q0VF55 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Atp2b3Q0VF55 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Atp2b3Q0VF55 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Atp2b3Q0VF55 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Atp2b3Q0VF55 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Atp2b3Q0VF55 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Atp2b3Q0VF55 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms