Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBF2

Tmem52b, Transmembrane protein 52B, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem52bQ0VBF2 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tmem52bQ0VBF2 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tmem52bQ0VBF2 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tmem52bQ0VBF2 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tmem52bQ0VBF2 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tmem52bQ0VBF2 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tmem52bQ0VBF2 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tmem52bQ0VBF2 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tmem52bQ0VBF2 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tmem52bQ0VBF2 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tmem52bQ0VBF2 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tmem52bQ0VBF2 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tmem52bQ0VBF2 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tmem52bQ0VBF2 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tmem52bQ0VBF2 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tmem52bQ0VBF2 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tmem52bQ0VBF2 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Tmem52bQ0VBF2 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tmem52bQ0VBF2 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tmem52bQ0VBF2 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tmem52bQ0VBF2 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tmem52bQ0VBF2 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tmem52bQ0VBF2 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tmem52bQ0VBF2 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tmem52bQ0VBF2 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Tmem52bQ0VBF2 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Tmem52bQ0VBF2 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tmem52bQ0VBF2 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tmem52bQ0VBF2 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tmem52bQ0VBF2 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tmem52bQ0VBF2 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tmem52bQ0VBF2 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tmem52bQ0VBF2 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tmem52bQ0VBF2 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tmem52bQ0VBF2 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tmem52bQ0VBF2 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tmem52bQ0VBF2 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tmem52bQ0VBF2 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Tmem52bQ0VBF2 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tmem52bQ0VBF2 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tmem52bQ0VBF2 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tmem52bQ0VBF2 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tmem52bQ0VBF2 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tmem52bQ0VBF2 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Tmem52bQ0VBF2 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tmem52bQ0VBF2 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Tmem52bQ0VBF2 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Tmem52bQ0VBF2 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tmem52bQ0VBF2 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Tmem52bQ0VBF2 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tmem52bQ0VBF2 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tmem52bQ0VBF2 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tmem52bQ0VBF2 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tmem52bQ0VBF2 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tmem52bQ0VBF2 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tmem52bQ0VBF2 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tmem52bQ0VBF2 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tmem52bQ0VBF2 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tmem52bQ0VBF2 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tmem52bQ0VBF2 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tmem52bQ0VBF2 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tmem52bQ0VBF2 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Tmem52bQ0VBF2 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tmem52bQ0VBF2 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tmem52bQ0VBF2 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tmem52bQ0VBF2 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tmem52bQ0VBF2 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tmem52bQ0VBF2 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tmem52bQ0VBF2 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tmem52bQ0VBF2 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tmem52bQ0VBF2 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Tmem52bQ0VBF2 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tmem52bQ0VBF2 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tmem52bQ0VBF2 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tmem52bQ0VBF2 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tmem52bQ0VBF2 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tmem52bQ0VBF2 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tmem52bQ0VBF2 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tmem52bQ0VBF2 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tmem52bQ0VBF2 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tmem52bQ0VBF2 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tmem52bQ0VBF2 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Tmem52bQ0VBF2 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tmem52bQ0VBF2 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tmem52bQ0VBF2 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tmem52bQ0VBF2 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tmem52bQ0VBF2 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tmem52bQ0VBF2 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tmem52bQ0VBF2 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tmem52bQ0VBF2 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tmem52bQ0VBF2 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tmem52bQ0VBF2 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tmem52bQ0VBF2 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tmem52bQ0VBF2 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tmem52bQ0VBF2 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tmem52bQ0VBF2 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tmem52bQ0VBF2 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tmem52bQ0VBF2 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Tmem52bQ0VBF2 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Tmem52bQ0VBF2 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms