Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb8Q0VBD0 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb8Q0VBD0 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itgb8Q0VBD0 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itgb8Q0VBD0 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itgb8Q0VBD0 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itgb8Q0VBD0 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itgb8Q0VBD0 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itgb8Q0VBD0 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itgb8Q0VBD0 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itgb8Q0VBD0 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itgb8Q0VBD0 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itgb8Q0VBD0 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itgb8Q0VBD0 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itgb8Q0VBD0 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itgb8Q0VBD0 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itgb8Q0VBD0 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itgb8Q0VBD0 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itgb8Q0VBD0 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itgb8Q0VBD0 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itgb8Q0VBD0 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itgb8Q0VBD0 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itgb8Q0VBD0 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itgb8Q0VBD0 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itgb8Q0VBD0 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itgb8Q0VBD0 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itgb8Q0VBD0 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itgb8Q0VBD0 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itgb8Q0VBD0 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itgb8Q0VBD0 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itgb8Q0VBD0 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itgb8Q0VBD0 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itgb8Q0VBD0 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itgb8Q0VBD0 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itgb8Q0VBD0 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Itgb8Q0VBD0 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itgb8Q0VBD0 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itgb8Q0VBD0 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itgb8Q0VBD0 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itgb8Q0VBD0 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itgb8Q0VBD0 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itgb8Q0VBD0 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itgb8Q0VBD0 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itgb8Q0VBD0 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Itgb8Q0VBD0 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itgb8Q0VBD0 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itgb8Q0VBD0 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itgb8Q0VBD0 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itgb8Q0VBD0 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itgb8Q0VBD0 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itgb8Q0VBD0 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itgb8Q0VBD0 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itgb8Q0VBD0 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itgb8Q0VBD0 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Itgb8Q0VBD0 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Itgb8Q0VBD0 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itgb8Q0VBD0 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itgb8Q0VBD0 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itgb8Q0VBD0 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itgb8Q0VBD0 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itgb8Q0VBD0 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itgb8Q0VBD0 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itgb8Q0VBD0 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itgb8Q0VBD0 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itgb8Q0VBD0 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itgb8Q0VBD0 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itgb8Q0VBD0 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Itgb8Q0VBD0 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itgb8Q0VBD0 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itgb8Q0VBD0 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itgb8Q0VBD0 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itgb8Q0VBD0 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itgb8Q0VBD0 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itgb8Q0VBD0 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itgb8Q0VBD0 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itgb8Q0VBD0 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itgb8Q0VBD0 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itgb8Q0VBD0 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itgb8Q0VBD0 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itgb8Q0VBD0 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itgb8Q0VBD0 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itgb8Q0VBD0 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itgb8Q0VBD0 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itgb8Q0VBD0 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Itgb8Q0VBD0 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itgb8Q0VBD0 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itgb8Q0VBD0 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itgb8Q0VBD0 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itgb8Q0VBD0 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itgb8Q0VBD0 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itgb8Q0VBD0 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itgb8Q0VBD0 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itgb8Q0VBD0 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itgb8Q0VBD0 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itgb8Q0VBD0 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itgb8Q0VBD0 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itgb8Q0VBD0 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itgb8Q0VBD0 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Itgb8Q0VBD0 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Itgb8Q0VBD0 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms