Protein–RNA interactions for Protein: Q0P557

Spata18, Mitochondria-eating protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata18Q0P557 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Spata18Q0P557 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Spata18Q0P557 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Spata18Q0P557 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Spata18Q0P557 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Spata18Q0P557 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Spata18Q0P557 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Spata18Q0P557 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Spata18Q0P557 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Spata18Q0P557 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Spata18Q0P557 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Spata18Q0P557 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Spata18Q0P557 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Spata18Q0P557 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Spata18Q0P557 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Spata18Q0P557 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Spata18Q0P557 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Spata18Q0P557 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Spata18Q0P557 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Spata18Q0P557 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Spata18Q0P557 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Spata18Q0P557 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Spata18Q0P557 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Spata18Q0P557 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Spata18Q0P557 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Spata18Q0P557 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Spata18Q0P557 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Spata18Q0P557 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Spata18Q0P557 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Spata18Q0P557 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Spata18Q0P557 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Spata18Q0P557 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Spata18Q0P557 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Spata18Q0P557 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Spata18Q0P557 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Spata18Q0P557 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Spata18Q0P557 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Spata18Q0P557 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Spata18Q0P557 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Spata18Q0P557 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Spata18Q0P557 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Spata18Q0P557 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Spata18Q0P557 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Spata18Q0P557 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Spata18Q0P557 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Spata18Q0P557 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Spata18Q0P557 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Spata18Q0P557 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Spata18Q0P557 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Spata18Q0P557 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Spata18Q0P557 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Spata18Q0P557 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Spata18Q0P557 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Spata18Q0P557 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Spata18Q0P557 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Spata18Q0P557 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Spata18Q0P557 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Spata18Q0P557 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Spata18Q0P557 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Spata18Q0P557 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Spata18Q0P557 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Spata18Q0P557 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Spata18Q0P557 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Spata18Q0P557 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Spata18Q0P557 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Spata18Q0P557 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Spata18Q0P557 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Spata18Q0P557 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Spata18Q0P557 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Spata18Q0P557 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Spata18Q0P557 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Spata18Q0P557 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Spata18Q0P557 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Spata18Q0P557 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Spata18Q0P557 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Spata18Q0P557 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Spata18Q0P557 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Spata18Q0P557 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Spata18Q0P557 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Spata18Q0P557 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Spata18Q0P557 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Spata18Q0P557 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Spata18Q0P557 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Spata18Q0P557 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Spata18Q0P557 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Spata18Q0P557 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Spata18Q0P557 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Spata18Q0P557 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Spata18Q0P557 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Spata18Q0P557 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Spata18Q0P557 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Spata18Q0P557 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Spata18Q0P557 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Spata18Q0P557 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Spata18Q0P557 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Spata18Q0P557 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Spata18Q0P557 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Spata18Q0P557 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Spata18Q0P557 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Spata18Q0P557 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms