Protein–RNA interactions for Protein: Q0MW30

Neurl1b, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, mousemouse

Predictions only

Length 546 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurl1bQ0MW30 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Neurl1bQ0MW30 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Neurl1bQ0MW30 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Neurl1bQ0MW30 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Neurl1bQ0MW30 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Neurl1bQ0MW30 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Neurl1bQ0MW30 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Neurl1bQ0MW30 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Neurl1bQ0MW30 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Neurl1bQ0MW30 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Neurl1bQ0MW30 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Neurl1bQ0MW30 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Neurl1bQ0MW30 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Neurl1bQ0MW30 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Neurl1bQ0MW30 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Neurl1bQ0MW30 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Neurl1bQ0MW30 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Neurl1bQ0MW30 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Neurl1bQ0MW30 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Neurl1bQ0MW30 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Neurl1bQ0MW30 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Neurl1bQ0MW30 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Neurl1bQ0MW30 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Neurl1bQ0MW30 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Neurl1bQ0MW30 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Neurl1bQ0MW30 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Neurl1bQ0MW30 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Neurl1bQ0MW30 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Neurl1bQ0MW30 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Neurl1bQ0MW30 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Neurl1bQ0MW30 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Neurl1bQ0MW30 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Neurl1bQ0MW30 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Neurl1bQ0MW30 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Neurl1bQ0MW30 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Neurl1bQ0MW30 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Neurl1bQ0MW30 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Neurl1bQ0MW30 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Neurl1bQ0MW30 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Neurl1bQ0MW30 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Neurl1bQ0MW30 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Neurl1bQ0MW30 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Neurl1bQ0MW30 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Neurl1bQ0MW30 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Neurl1bQ0MW30 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Neurl1bQ0MW30 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Neurl1bQ0MW30 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Neurl1bQ0MW30 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Neurl1bQ0MW30 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Neurl1bQ0MW30 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Neurl1bQ0MW30 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Neurl1bQ0MW30 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Neurl1bQ0MW30 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Neurl1bQ0MW30 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Neurl1bQ0MW30 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Neurl1bQ0MW30 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Neurl1bQ0MW30 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Neurl1bQ0MW30 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Neurl1bQ0MW30 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Neurl1bQ0MW30 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Neurl1bQ0MW30 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Neurl1bQ0MW30 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Neurl1bQ0MW30 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Neurl1bQ0MW30 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Neurl1bQ0MW30 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Neurl1bQ0MW30 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Neurl1bQ0MW30 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Neurl1bQ0MW30 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Neurl1bQ0MW30 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Neurl1bQ0MW30 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Neurl1bQ0MW30 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Neurl1bQ0MW30 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Neurl1bQ0MW30 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Neurl1bQ0MW30 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Neurl1bQ0MW30 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Neurl1bQ0MW30 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Neurl1bQ0MW30 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Neurl1bQ0MW30 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Neurl1bQ0MW30 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Neurl1bQ0MW30 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Neurl1bQ0MW30 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Neurl1bQ0MW30 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Neurl1bQ0MW30 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Neurl1bQ0MW30 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Neurl1bQ0MW30 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Neurl1bQ0MW30 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Neurl1bQ0MW30 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Neurl1bQ0MW30 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Neurl1bQ0MW30 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Neurl1bQ0MW30 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Neurl1bQ0MW30 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Neurl1bQ0MW30 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Neurl1bQ0MW30 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Neurl1bQ0MW30 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Neurl1bQ0MW30 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Neurl1bQ0MW30 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Neurl1bQ0MW30 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Neurl1bQ0MW30 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Neurl1bQ0MW30 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Neurl1bQ0MW30 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms