Protein–RNA interactions for Protein: Q0KK55

Kndc1, Protein very KIND, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kndc1Q0KK55 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Kndc1Q0KK55 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Kndc1Q0KK55 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Kndc1Q0KK55 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Kndc1Q0KK55 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Kndc1Q0KK55 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Kndc1Q0KK55 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Kndc1Q0KK55 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Kndc1Q0KK55 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Kndc1Q0KK55 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Kndc1Q0KK55 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Kndc1Q0KK55 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Kndc1Q0KK55 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Kndc1Q0KK55 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Kndc1Q0KK55 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Kndc1Q0KK55 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Kndc1Q0KK55 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Kndc1Q0KK55 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Kndc1Q0KK55 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Kndc1Q0KK55 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Kndc1Q0KK55 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Kndc1Q0KK55 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Kndc1Q0KK55 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Kndc1Q0KK55 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Kndc1Q0KK55 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Kndc1Q0KK55 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Kndc1Q0KK55 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Kndc1Q0KK55 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Kndc1Q0KK55 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Kndc1Q0KK55 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Kndc1Q0KK55 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Kndc1Q0KK55 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Kndc1Q0KK55 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Kndc1Q0KK55 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Kndc1Q0KK55 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Kndc1Q0KK55 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Kndc1Q0KK55 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Kndc1Q0KK55 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Kndc1Q0KK55 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Kndc1Q0KK55 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Kndc1Q0KK55 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Kndc1Q0KK55 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kndc1Q0KK55 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kndc1Q0KK55 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kndc1Q0KK55 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kndc1Q0KK55 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kndc1Q0KK55 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kndc1Q0KK55 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kndc1Q0KK55 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kndc1Q0KK55 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kndc1Q0KK55 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kndc1Q0KK55 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kndc1Q0KK55 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kndc1Q0KK55 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Kndc1Q0KK55 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Kndc1Q0KK55 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Kndc1Q0KK55 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Kndc1Q0KK55 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Kndc1Q0KK55 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Kndc1Q0KK55 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Kndc1Q0KK55 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Kndc1Q0KK55 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Kndc1Q0KK55 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Kndc1Q0KK55 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Kndc1Q0KK55 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Kndc1Q0KK55 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Kndc1Q0KK55 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Kndc1Q0KK55 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Kndc1Q0KK55 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Kndc1Q0KK55 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Kndc1Q0KK55 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Kndc1Q0KK55 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Kndc1Q0KK55 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Kndc1Q0KK55 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Kndc1Q0KK55 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Kndc1Q0KK55 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Kndc1Q0KK55 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Kndc1Q0KK55 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Kndc1Q0KK55 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Kndc1Q0KK55 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Kndc1Q0KK55 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Kndc1Q0KK55 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Kndc1Q0KK55 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Kndc1Q0KK55 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Kndc1Q0KK55 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Kndc1Q0KK55 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Kndc1Q0KK55 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Kndc1Q0KK55 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Kndc1Q0KK55 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Kndc1Q0KK55 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Kndc1Q0KK55 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Kndc1Q0KK55 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Kndc1Q0KK55 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Kndc1Q0KK55 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Kndc1Q0KK55 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Kndc1Q0KK55 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Kndc1Q0KK55 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Kndc1Q0KK55 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Kndc1Q0KK55 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Kndc1Q0KK55 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms