Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ttc21bQ0HA38 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Ttc21bQ0HA38 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ttc21bQ0HA38 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ttc21bQ0HA38 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ttc21bQ0HA38 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ttc21bQ0HA38 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ttc21bQ0HA38 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Ttc21bQ0HA38 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ttc21bQ0HA38 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ttc21bQ0HA38 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ttc21bQ0HA38 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ttc21bQ0HA38 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ttc21bQ0HA38 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ttc21bQ0HA38 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ttc21bQ0HA38 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ttc21bQ0HA38 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ttc21bQ0HA38 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ttc21bQ0HA38 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Ttc21bQ0HA38 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ttc21bQ0HA38 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ttc21bQ0HA38 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ttc21bQ0HA38 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ttc21bQ0HA38 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ttc21bQ0HA38 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.47
Ttc21bQ0HA38 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ttc21bQ0HA38 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ttc21bQ0HA38 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ttc21bQ0HA38 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ttc21bQ0HA38 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ttc21bQ0HA38 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ttc21bQ0HA38 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ttc21bQ0HA38 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ttc21bQ0HA38 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ttc21bQ0HA38 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ttc21bQ0HA38 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ttc21bQ0HA38 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ttc21bQ0HA38 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ttc21bQ0HA38 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ttc21bQ0HA38 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ttc21bQ0HA38 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ttc21bQ0HA38 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ttc21bQ0HA38 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ttc21bQ0HA38 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ttc21bQ0HA38 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ttc21bQ0HA38 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ttc21bQ0HA38 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ttc21bQ0HA38 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ttc21bQ0HA38 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ttc21bQ0HA38 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ttc21bQ0HA38 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ttc21bQ0HA38 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ttc21bQ0HA38 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Ttc21bQ0HA38 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ttc21bQ0HA38 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ttc21bQ0HA38 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ttc21bQ0HA38 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Ttc21bQ0HA38 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Ttc21bQ0HA38 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Ttc21bQ0HA38 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ttc21bQ0HA38 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ttc21bQ0HA38 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ttc21bQ0HA38 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ttc21bQ0HA38 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ttc21bQ0HA38 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ttc21bQ0HA38 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ttc21bQ0HA38 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ttc21bQ0HA38 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ttc21bQ0HA38 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ttc21bQ0HA38 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ttc21bQ0HA38 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ttc21bQ0HA38 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ttc21bQ0HA38 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ttc21bQ0HA38 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ttc21bQ0HA38 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ttc21bQ0HA38 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ttc21bQ0HA38 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ttc21bQ0HA38 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ttc21bQ0HA38 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Ttc21bQ0HA38 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ttc21bQ0HA38 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ttc21bQ0HA38 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ttc21bQ0HA38 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ttc21bQ0HA38 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ttc21bQ0HA38 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ttc21bQ0HA38 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ttc21bQ0HA38 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ttc21bQ0HA38 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ttc21bQ0HA38 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ttc21bQ0HA38 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ttc21bQ0HA38 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ttc21bQ0HA38 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ttc21bQ0HA38 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ttc21bQ0HA38 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ttc21bQ0HA38 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Ttc21bQ0HA38 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ttc21bQ0HA38 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ttc21bQ0HA38 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ttc21bQ0HA38 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ttc21bQ0HA38 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms