Protein–RNA interactions for Protein: Q08EC4

Cass4, Cas scaffolding protein family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cass4Q08EC4 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cass4Q08EC4 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cass4Q08EC4 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cass4Q08EC4 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cass4Q08EC4 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cass4Q08EC4 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cass4Q08EC4 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cass4Q08EC4 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cass4Q08EC4 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cass4Q08EC4 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cass4Q08EC4 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cass4Q08EC4 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cass4Q08EC4 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cass4Q08EC4 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cass4Q08EC4 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cass4Q08EC4 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cass4Q08EC4 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cass4Q08EC4 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cass4Q08EC4 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cass4Q08EC4 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cass4Q08EC4 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cass4Q08EC4 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cass4Q08EC4 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cass4Q08EC4 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cass4Q08EC4 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cass4Q08EC4 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cass4Q08EC4 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cass4Q08EC4 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cass4Q08EC4 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cass4Q08EC4 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cass4Q08EC4 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cass4Q08EC4 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cass4Q08EC4 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cass4Q08EC4 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cass4Q08EC4 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cass4Q08EC4 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cass4Q08EC4 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cass4Q08EC4 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cass4Q08EC4 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cass4Q08EC4 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cass4Q08EC4 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cass4Q08EC4 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cass4Q08EC4 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cass4Q08EC4 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cass4Q08EC4 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cass4Q08EC4 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cass4Q08EC4 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cass4Q08EC4 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cass4Q08EC4 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cass4Q08EC4 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cass4Q08EC4 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cass4Q08EC4 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cass4Q08EC4 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cass4Q08EC4 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cass4Q08EC4 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cass4Q08EC4 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cass4Q08EC4 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cass4Q08EC4 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cass4Q08EC4 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cass4Q08EC4 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cass4Q08EC4 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cass4Q08EC4 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cass4Q08EC4 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cass4Q08EC4 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cass4Q08EC4 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cass4Q08EC4 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cass4Q08EC4 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cass4Q08EC4 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cass4Q08EC4 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cass4Q08EC4 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cass4Q08EC4 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cass4Q08EC4 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cass4Q08EC4 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cass4Q08EC4 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cass4Q08EC4 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cass4Q08EC4 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cass4Q08EC4 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cass4Q08EC4 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cass4Q08EC4 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cass4Q08EC4 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cass4Q08EC4 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cass4Q08EC4 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cass4Q08EC4 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cass4Q08EC4 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cass4Q08EC4 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cass4Q08EC4 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cass4Q08EC4 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cass4Q08EC4 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cass4Q08EC4 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cass4Q08EC4 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cass4Q08EC4 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cass4Q08EC4 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cass4Q08EC4 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cass4Q08EC4 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Cass4Q08EC4 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cass4Q08EC4 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cass4Q08EC4 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cass4Q08EC4 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Cass4Q08EC4 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cass4Q08EC4 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms