Protein–RNA interactions for Protein: Q08943

Ssrp1, FACT complex subunit SSRP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssrp1Q08943 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ssrp1Q08943 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ssrp1Q08943 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Ssrp1Q08943 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ssrp1Q08943 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ssrp1Q08943 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ssrp1Q08943 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ssrp1Q08943 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ssrp1Q08943 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ssrp1Q08943 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ssrp1Q08943 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ssrp1Q08943 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ssrp1Q08943 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ssrp1Q08943 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ssrp1Q08943 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ssrp1Q08943 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ssrp1Q08943 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ssrp1Q08943 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ssrp1Q08943 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ssrp1Q08943 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Ssrp1Q08943 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ssrp1Q08943 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ssrp1Q08943 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ssrp1Q08943 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ssrp1Q08943 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ssrp1Q08943 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ssrp1Q08943 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ssrp1Q08943 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ssrp1Q08943 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ssrp1Q08943 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ssrp1Q08943 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Ssrp1Q08943 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ssrp1Q08943 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ssrp1Q08943 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ssrp1Q08943 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ssrp1Q08943 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ssrp1Q08943 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ssrp1Q08943 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ssrp1Q08943 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ssrp1Q08943 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ssrp1Q08943 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ssrp1Q08943 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ssrp1Q08943 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ssrp1Q08943 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ssrp1Q08943 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ssrp1Q08943 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ssrp1Q08943 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ssrp1Q08943 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Ssrp1Q08943 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ssrp1Q08943 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ssrp1Q08943 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ssrp1Q08943 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ssrp1Q08943 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ssrp1Q08943 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ssrp1Q08943 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ssrp1Q08943 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ssrp1Q08943 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ssrp1Q08943 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Ssrp1Q08943 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ssrp1Q08943 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ssrp1Q08943 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ssrp1Q08943 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ssrp1Q08943 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ssrp1Q08943 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ssrp1Q08943 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ssrp1Q08943 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ssrp1Q08943 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ssrp1Q08943 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ssrp1Q08943 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ssrp1Q08943 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ssrp1Q08943 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ssrp1Q08943 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ssrp1Q08943 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ssrp1Q08943 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ssrp1Q08943 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ssrp1Q08943 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ssrp1Q08943 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ssrp1Q08943 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ssrp1Q08943 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ssrp1Q08943 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ssrp1Q08943 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ssrp1Q08943 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ssrp1Q08943 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ssrp1Q08943 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ssrp1Q08943 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ssrp1Q08943 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ssrp1Q08943 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Ssrp1Q08943 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ssrp1Q08943 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Ssrp1Q08943 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ssrp1Q08943 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ssrp1Q08943 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ssrp1Q08943 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ssrp1Q08943 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ssrp1Q08943 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ssrp1Q08943 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ssrp1Q08943 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ssrp1Q08943 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ssrp1Q08943 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ssrp1Q08943 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms