Protein–RNA interactions for Protein: Q08624

Hoxc4, Homeobox protein Hox-C4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc4Q08624 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc4Q08624 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc4Q08624 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc4Q08624 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc4Q08624 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc4Q08624 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc4Q08624 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc4Q08624 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc4Q08624 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc4Q08624 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc4Q08624 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc4Q08624 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc4Q08624 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc4Q08624 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc4Q08624 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc4Q08624 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc4Q08624 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc4Q08624 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc4Q08624 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc4Q08624 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc4Q08624 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc4Q08624 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc4Q08624 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc4Q08624 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc4Q08624 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc4Q08624 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc4Q08624 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxc4Q08624 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxc4Q08624 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxc4Q08624 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxc4Q08624 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxc4Q08624 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxc4Q08624 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxc4Q08624 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxc4Q08624 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxc4Q08624 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxc4Q08624 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxc4Q08624 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxc4Q08624 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxc4Q08624 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxc4Q08624 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxc4Q08624 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxc4Q08624 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxc4Q08624 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxc4Q08624 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxc4Q08624 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxc4Q08624 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxc4Q08624 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxc4Q08624 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxc4Q08624 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxc4Q08624 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxc4Q08624 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxc4Q08624 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxc4Q08624 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxc4Q08624 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxc4Q08624 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxc4Q08624 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxc4Q08624 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxc4Q08624 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxc4Q08624 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxc4Q08624 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxc4Q08624 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxc4Q08624 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxc4Q08624 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxc4Q08624 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxc4Q08624 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxc4Q08624 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxc4Q08624 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxc4Q08624 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxc4Q08624 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxc4Q08624 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxc4Q08624 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxc4Q08624 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxc4Q08624 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxc4Q08624 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxc4Q08624 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxc4Q08624 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxc4Q08624 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxc4Q08624 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxc4Q08624 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxc4Q08624 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxc4Q08624 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxc4Q08624 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxc4Q08624 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxc4Q08624 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxc4Q08624 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxc4Q08624 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxc4Q08624 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxc4Q08624 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxc4Q08624 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxc4Q08624 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxc4Q08624 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxc4Q08624 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxc4Q08624 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxc4Q08624 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxc4Q08624 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxc4Q08624 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxc4Q08624 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxc4Q08624 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxc4Q08624 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms