Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Kcnma1Q08460 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Kcnma1Q08460 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Kcnma1Q08460 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Kcnma1Q08460 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Kcnma1Q08460 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kcnma1Q08460 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kcnma1Q08460 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kcnma1Q08460 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kcnma1Q08460 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kcnma1Q08460 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kcnma1Q08460 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kcnma1Q08460 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kcnma1Q08460 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kcnma1Q08460 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kcnma1Q08460 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kcnma1Q08460 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Kcnma1Q08460 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kcnma1Q08460 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kcnma1Q08460 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kcnma1Q08460 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kcnma1Q08460 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kcnma1Q08460 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kcnma1Q08460 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Kcnma1Q08460 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Kcnma1Q08460 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Kcnma1Q08460 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Kcnma1Q08460 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Kcnma1Q08460 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Kcnma1Q08460 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Kcnma1Q08460 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Kcnma1Q08460 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Kcnma1Q08460 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Kcnma1Q08460 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Kcnma1Q08460 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Kcnma1Q08460 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Kcnma1Q08460 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Kcnma1Q08460 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Kcnma1Q08460 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Kcnma1Q08460 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Kcnma1Q08460 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Kcnma1Q08460 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Kcnma1Q08460 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Kcnma1Q08460 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Kcnma1Q08460 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Kcnma1Q08460 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Kcnma1Q08460 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Kcnma1Q08460 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Kcnma1Q08460 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Kcnma1Q08460 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Kcnma1Q08460 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Kcnma1Q08460 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Kcnma1Q08460 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Kcnma1Q08460 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Kcnma1Q08460 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Kcnma1Q08460 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Kcnma1Q08460 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Kcnma1Q08460 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Kcnma1Q08460 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Kcnma1Q08460 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Kcnma1Q08460 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Kcnma1Q08460 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Kcnma1Q08460 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Kcnma1Q08460 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Kcnma1Q08460 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Kcnma1Q08460 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Kcnma1Q08460 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Kcnma1Q08460 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Kcnma1Q08460 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Kcnma1Q08460 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Kcnma1Q08460 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Kcnma1Q08460 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Kcnma1Q08460 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Kcnma1Q08460 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Kcnma1Q08460 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Kcnma1Q08460 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Kcnma1Q08460 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Kcnma1Q08460 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Kcnma1Q08460 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Kcnma1Q08460 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Kcnma1Q08460 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Kcnma1Q08460 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Kcnma1Q08460 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Kcnma1Q08460 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Kcnma1Q08460 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Kcnma1Q08460 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Kcnma1Q08460 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Kcnma1Q08460 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Kcnma1Q08460 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Kcnma1Q08460 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Kcnma1Q08460 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Kcnma1Q08460 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Kcnma1Q08460 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Kcnma1Q08460 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Kcnma1Q08460 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Kcnma1Q08460 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Kcnma1Q08460 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Kcnma1Q08460 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Kcnma1Q08460 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Kcnma1Q08460 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms