Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Gata4Q08369 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Gata4Q08369 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gata4Q08369 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gata4Q08369 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gata4Q08369 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gata4Q08369 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gata4Q08369 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gata4Q08369 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gata4Q08369 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gata4Q08369 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gata4Q08369 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Gata4Q08369 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gata4Q08369 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gata4Q08369 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gata4Q08369 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gata4Q08369 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gata4Q08369 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gata4Q08369 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gata4Q08369 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gata4Q08369 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gata4Q08369 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Gata4Q08369 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gata4Q08369 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gata4Q08369 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gata4Q08369 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gata4Q08369 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gata4Q08369 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gata4Q08369 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gata4Q08369 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gata4Q08369 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gata4Q08369 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gata4Q08369 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gata4Q08369 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gata4Q08369 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gata4Q08369 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gata4Q08369 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gata4Q08369 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gata4Q08369 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gata4Q08369 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gata4Q08369 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Gata4Q08369 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gata4Q08369 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gata4Q08369 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gata4Q08369 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gata4Q08369 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gata4Q08369 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gata4Q08369 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gata4Q08369 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gata4Q08369 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gata4Q08369 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gata4Q08369 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gata4Q08369 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gata4Q08369 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gata4Q08369 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gata4Q08369 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gata4Q08369 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gata4Q08369 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gata4Q08369 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gata4Q08369 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gata4Q08369 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gata4Q08369 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gata4Q08369 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Gata4Q08369 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gata4Q08369 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Gata4Q08369 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gata4Q08369 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gata4Q08369 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gata4Q08369 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gata4Q08369 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gata4Q08369 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Gata4Q08369 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Gata4Q08369 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gata4Q08369 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gata4Q08369 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gata4Q08369 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gata4Q08369 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gata4Q08369 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gata4Q08369 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gata4Q08369 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Gata4Q08369 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Gata4Q08369 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
Gata4Q08369 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Gata4Q08369 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Gata4Q08369 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Gata4Q08369 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gata4Q08369 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gata4Q08369 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gata4Q08369 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gata4Q08369 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gata4Q08369 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gata4Q08369 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Gata4Q08369 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gata4Q08369 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gata4Q08369 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gata4Q08369 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gata4Q08369 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Gata4Q08369 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Gata4Q08369 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gata4Q08369 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms