Protein–RNA interactions for Protein: Q08093

Cnn2, Calponin-2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn2Q08093 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnn2Q08093 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnn2Q08093 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnn2Q08093 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnn2Q08093 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnn2Q08093 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cnn2Q08093 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cnn2Q08093 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnn2Q08093 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnn2Q08093 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnn2Q08093 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnn2Q08093 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnn2Q08093 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnn2Q08093 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnn2Q08093 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnn2Q08093 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnn2Q08093 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnn2Q08093 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnn2Q08093 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnn2Q08093 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnn2Q08093 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnn2Q08093 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnn2Q08093 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnn2Q08093 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnn2Q08093 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnn2Q08093 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnn2Q08093 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnn2Q08093 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnn2Q08093 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnn2Q08093 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnn2Q08093 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnn2Q08093 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnn2Q08093 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnn2Q08093 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnn2Q08093 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnn2Q08093 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnn2Q08093 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnn2Q08093 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnn2Q08093 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnn2Q08093 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnn2Q08093 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnn2Q08093 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnn2Q08093 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnn2Q08093 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnn2Q08093 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnn2Q08093 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnn2Q08093 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnn2Q08093 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnn2Q08093 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnn2Q08093 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnn2Q08093 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnn2Q08093 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnn2Q08093 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnn2Q08093 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnn2Q08093 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnn2Q08093 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnn2Q08093 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnn2Q08093 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnn2Q08093 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnn2Q08093 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnn2Q08093 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnn2Q08093 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnn2Q08093 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnn2Q08093 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnn2Q08093 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnn2Q08093 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnn2Q08093 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnn2Q08093 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnn2Q08093 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnn2Q08093 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnn2Q08093 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnn2Q08093 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnn2Q08093 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnn2Q08093 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnn2Q08093 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnn2Q08093 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnn2Q08093 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnn2Q08093 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnn2Q08093 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnn2Q08093 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnn2Q08093 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnn2Q08093 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnn2Q08093 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnn2Q08093 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnn2Q08093 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnn2Q08093 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnn2Q08093 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnn2Q08093 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnn2Q08093 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnn2Q08093 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnn2Q08093 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnn2Q08093 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnn2Q08093 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnn2Q08093 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnn2Q08093 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnn2Q08093 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnn2Q08093 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnn2Q08093 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnn2Q08093 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnn2Q08093 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms