Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MestQ07646 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MestQ07646 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MestQ07646 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MestQ07646 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MestQ07646 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MestQ07646 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MestQ07646 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MestQ07646 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MestQ07646 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MestQ07646 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MestQ07646 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MestQ07646 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MestQ07646 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MestQ07646 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MestQ07646 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MestQ07646 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MestQ07646 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MestQ07646 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MestQ07646 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MestQ07646 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MestQ07646 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MestQ07646 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MestQ07646 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MestQ07646 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MestQ07646 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MestQ07646 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MestQ07646 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MestQ07646 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MestQ07646 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MestQ07646 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MestQ07646 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MestQ07646 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MestQ07646 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MestQ07646 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MestQ07646 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
MestQ07646 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MestQ07646 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MestQ07646 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MestQ07646 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MestQ07646 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MestQ07646 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MestQ07646 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MestQ07646 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MestQ07646 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
MestQ07646 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MestQ07646 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MestQ07646 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MestQ07646 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MestQ07646 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MestQ07646 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MestQ07646 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
MestQ07646 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MestQ07646 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
MestQ07646 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MestQ07646 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MestQ07646 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
MestQ07646 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MestQ07646 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MestQ07646 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MestQ07646 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MestQ07646 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MestQ07646 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MestQ07646 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MestQ07646 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MestQ07646 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MestQ07646 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MestQ07646 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MestQ07646 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MestQ07646 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MestQ07646 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MestQ07646 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MestQ07646 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MestQ07646 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MestQ07646 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MestQ07646 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MestQ07646 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MestQ07646 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MestQ07646 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MestQ07646 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MestQ07646 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MestQ07646 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MestQ07646 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MestQ07646 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MestQ07646 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MestQ07646 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MestQ07646 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MestQ07646 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MestQ07646 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MestQ07646 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MestQ07646 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MestQ07646 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MestQ07646 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MestQ07646 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MestQ07646 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MestQ07646 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MestQ07646 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MestQ07646 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MestQ07646 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MestQ07646 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms