Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cntn3Q07409 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cntn3Q07409 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cntn3Q07409 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cntn3Q07409 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cntn3Q07409 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cntn3Q07409 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cntn3Q07409 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cntn3Q07409 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cntn3Q07409 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cntn3Q07409 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cntn3Q07409 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cntn3Q07409 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cntn3Q07409 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cntn3Q07409 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cntn3Q07409 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cntn3Q07409 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cntn3Q07409 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cntn3Q07409 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cntn3Q07409 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cntn3Q07409 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cntn3Q07409 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cntn3Q07409 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cntn3Q07409 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Cntn3Q07409 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cntn3Q07409 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cntn3Q07409 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cntn3Q07409 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cntn3Q07409 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cntn3Q07409 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cntn3Q07409 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cntn3Q07409 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cntn3Q07409 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cntn3Q07409 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cntn3Q07409 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cntn3Q07409 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cntn3Q07409 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cntn3Q07409 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cntn3Q07409 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cntn3Q07409 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cntn3Q07409 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cntn3Q07409 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cntn3Q07409 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cntn3Q07409 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cntn3Q07409 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cntn3Q07409 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cntn3Q07409 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cntn3Q07409 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cntn3Q07409 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Cntn3Q07409 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cntn3Q07409 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cntn3Q07409 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cntn3Q07409 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cntn3Q07409 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cntn3Q07409 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cntn3Q07409 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cntn3Q07409 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cntn3Q07409 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cntn3Q07409 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cntn3Q07409 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cntn3Q07409 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cntn3Q07409 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Cntn3Q07409 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cntn3Q07409 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cntn3Q07409 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cntn3Q07409 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cntn3Q07409 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cntn3Q07409 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cntn3Q07409 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cntn3Q07409 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cntn3Q07409 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cntn3Q07409 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cntn3Q07409 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cntn3Q07409 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cntn3Q07409 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cntn3Q07409 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cntn3Q07409 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cntn3Q07409 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cntn3Q07409 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cntn3Q07409 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cntn3Q07409 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cntn3Q07409 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cntn3Q07409 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cntn3Q07409 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cntn3Q07409 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cntn3Q07409 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cntn3Q07409 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cntn3Q07409 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cntn3Q07409 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cntn3Q07409 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cntn3Q07409 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cntn3Q07409 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cntn3Q07409 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cntn3Q07409 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cntn3Q07409 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cntn3Q07409 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Cntn3Q07409 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Cntn3Q07409 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cntn3Q07409 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cntn3Q07409 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms