Protein–RNA interactions for Protein: Q06507

Atf4, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-4, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf4Q06507 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atf4Q06507 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atf4Q06507 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atf4Q06507 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Atf4Q06507 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atf4Q06507 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atf4Q06507 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atf4Q06507 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atf4Q06507 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atf4Q06507 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Atf4Q06507 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atf4Q06507 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atf4Q06507 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Atf4Q06507 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atf4Q06507 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atf4Q06507 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atf4Q06507 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atf4Q06507 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atf4Q06507 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atf4Q06507 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atf4Q06507 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atf4Q06507 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atf4Q06507 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atf4Q06507 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atf4Q06507 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atf4Q06507 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atf4Q06507 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atf4Q06507 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Atf4Q06507 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atf4Q06507 Gm11361-201ENSMUST00000223428 607 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atf4Q06507 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atf4Q06507 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atf4Q06507 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atf4Q06507 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atf4Q06507 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atf4Q06507 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atf4Q06507 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atf4Q06507 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atf4Q06507 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atf4Q06507 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atf4Q06507 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atf4Q06507 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atf4Q06507 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atf4Q06507 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atf4Q06507 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atf4Q06507 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atf4Q06507 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atf4Q06507 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atf4Q06507 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Atf4Q06507 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atf4Q06507 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atf4Q06507 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atf4Q06507 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Atf4Q06507 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Atf4Q06507 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atf4Q06507 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atf4Q06507 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atf4Q06507 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atf4Q06507 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atf4Q06507 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atf4Q06507 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atf4Q06507 Gm14716-201ENSMUST00000120138 718 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Atf4Q06507 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atf4Q06507 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atf4Q06507 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atf4Q06507 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atf4Q06507 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atf4Q06507 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Atf4Q06507 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atf4Q06507 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atf4Q06507 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atf4Q06507 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Atf4Q06507 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atf4Q06507 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atf4Q06507 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atf4Q06507 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atf4Q06507 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atf4Q06507 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atf4Q06507 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atf4Q06507 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atf4Q06507 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atf4Q06507 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atf4Q06507 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atf4Q06507 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atf4Q06507 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Atf4Q06507 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Atf4Q06507 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atf4Q06507 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atf4Q06507 Klk1b7-ps-201ENSMUST00000078897 448 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atf4Q06507 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atf4Q06507 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atf4Q06507 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atf4Q06507 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atf4Q06507 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atf4Q06507 Gm38116-201ENSMUST00000193873 1533 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Atf4Q06507 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atf4Q06507 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Atf4Q06507 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atf4Q06507 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Atf4Q06507 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms