Protein–RNA interactions for Protein: Q05860

Fmn1, Formin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fmn1Q05860 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Fmn1Q05860 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Fmn1Q05860 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Fmn1Q05860 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Fmn1Q05860 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Fmn1Q05860 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Fmn1Q05860 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Fmn1Q05860 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Fmn1Q05860 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Fmn1Q05860 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Fmn1Q05860 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Fmn1Q05860 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Fmn1Q05860 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Fmn1Q05860 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Fmn1Q05860 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Fmn1Q05860 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Fmn1Q05860 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Fmn1Q05860 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Fmn1Q05860 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Fmn1Q05860 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Fmn1Q05860 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Fmn1Q05860 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Fmn1Q05860 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Fmn1Q05860 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Fmn1Q05860 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Fmn1Q05860 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Fmn1Q05860 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Fmn1Q05860 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Fmn1Q05860 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Fmn1Q05860 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Fmn1Q05860 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Fmn1Q05860 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Fmn1Q05860 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Fmn1Q05860 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Fmn1Q05860 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Fmn1Q05860 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Fmn1Q05860 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Fmn1Q05860 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Fmn1Q05860 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Fmn1Q05860 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Fmn1Q05860 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Fmn1Q05860 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Fmn1Q05860 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Fmn1Q05860 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Fmn1Q05860 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Fmn1Q05860 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Fmn1Q05860 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Fmn1Q05860 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Fmn1Q05860 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Fmn1Q05860 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Fmn1Q05860 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Fmn1Q05860 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Fmn1Q05860 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Fmn1Q05860 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Fmn1Q05860 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Fmn1Q05860 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Fmn1Q05860 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Fmn1Q05860 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Fmn1Q05860 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Fmn1Q05860 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Fmn1Q05860 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
Fmn1Q05860 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Fmn1Q05860 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Fmn1Q05860 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Fmn1Q05860 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Fmn1Q05860 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Fmn1Q05860 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Fmn1Q05860 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Fmn1Q05860 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Fmn1Q05860 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Fmn1Q05860 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Fmn1Q05860 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Fmn1Q05860 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Fmn1Q05860 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Fmn1Q05860 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Fmn1Q05860 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Fmn1Q05860 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Fmn1Q05860 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Fmn1Q05860 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Fmn1Q05860 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Fmn1Q05860 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Fmn1Q05860 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Fmn1Q05860 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Fmn1Q05860 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Fmn1Q05860 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Fmn1Q05860 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Fmn1Q05860 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Fmn1Q05860 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Fmn1Q05860 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Fmn1Q05860 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Fmn1Q05860 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Fmn1Q05860 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Fmn1Q05860 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Fmn1Q05860 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Fmn1Q05860 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Fmn1Q05860 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Fmn1Q05860 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Fmn1Q05860 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Fmn1Q05860 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Fmn1Q05860 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms