Protein–RNA interactions for Protein: Q05306

Col10a1, Collagen alpha-1(X) chain, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col10a1Q05306 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Col10a1Q05306 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Col10a1Q05306 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col10a1Q05306 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col10a1Q05306 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Col10a1Q05306 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col10a1Q05306 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col10a1Q05306 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Col10a1Q05306 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col10a1Q05306 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col10a1Q05306 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col10a1Q05306 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col10a1Q05306 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col10a1Q05306 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col10a1Q05306 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col10a1Q05306 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col10a1Q05306 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col10a1Q05306 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col10a1Q05306 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col10a1Q05306 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col10a1Q05306 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col10a1Q05306 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Col10a1Q05306 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col10a1Q05306 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col10a1Q05306 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col10a1Q05306 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col10a1Q05306 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col10a1Q05306 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col10a1Q05306 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col10a1Q05306 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col10a1Q05306 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col10a1Q05306 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col10a1Q05306 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col10a1Q05306 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col10a1Q05306 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col10a1Q05306 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col10a1Q05306 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col10a1Q05306 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col10a1Q05306 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col10a1Q05306 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col10a1Q05306 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col10a1Q05306 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col10a1Q05306 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col10a1Q05306 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col10a1Q05306 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col10a1Q05306 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col10a1Q05306 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col10a1Q05306 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col10a1Q05306 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col10a1Q05306 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col10a1Q05306 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col10a1Q05306 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col10a1Q05306 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col10a1Q05306 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col10a1Q05306 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col10a1Q05306 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col10a1Q05306 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col10a1Q05306 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Col10a1Q05306 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col10a1Q05306 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col10a1Q05306 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col10a1Q05306 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col10a1Q05306 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col10a1Q05306 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col10a1Q05306 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col10a1Q05306 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col10a1Q05306 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col10a1Q05306 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col10a1Q05306 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col10a1Q05306 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col10a1Q05306 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col10a1Q05306 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col10a1Q05306 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col10a1Q05306 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Col10a1Q05306 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Col10a1Q05306 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Col10a1Q05306 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Col10a1Q05306 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Col10a1Q05306 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Col10a1Q05306 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Col10a1Q05306 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Col10a1Q05306 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Col10a1Q05306 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Col10a1Q05306 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Col10a1Q05306 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Col10a1Q05306 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Col10a1Q05306 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Col10a1Q05306 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Col10a1Q05306 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Col10a1Q05306 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Col10a1Q05306 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Col10a1Q05306 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Col10a1Q05306 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Col10a1Q05306 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Col10a1Q05306 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Col10a1Q05306 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Col10a1Q05306 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Col10a1Q05306 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Col10a1Q05306 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col10a1Q05306 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms