Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Sox12Q04890 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Sox12Q04890 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Sox12Q04890 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Sox12Q04890 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sox12Q04890 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sox12Q04890 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sox12Q04890 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sox12Q04890 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sox12Q04890 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Sox12Q04890 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sox12Q04890 Thoc7-209ENSMUST00000225325 765 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Sox12Q04890 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Sox12Q04890 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sox12Q04890 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sox12Q04890 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sox12Q04890 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sox12Q04890 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sox12Q04890 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Sox12Q04890 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Sox12Q04890 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sox12Q04890 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sox12Q04890 Prl8a1-201ENSMUST00000006664 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sox12Q04890 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Sox12Q04890 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sox12Q04890 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sox12Q04890 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sox12Q04890 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sox12Q04890 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sox12Q04890 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sox12Q04890 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sox12Q04890 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sox12Q04890 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Sox12Q04890 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sox12Q04890 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sox12Q04890 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sox12Q04890 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sox12Q04890 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sox12Q04890 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Sox12Q04890 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sox12Q04890 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sox12Q04890 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sox12Q04890 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sox12Q04890 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sox12Q04890 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sox12Q04890 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sox12Q04890 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sox12Q04890 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Sox12Q04890 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sox12Q04890 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sox12Q04890 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sox12Q04890 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sox12Q04890 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sox12Q04890 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sox12Q04890 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sox12Q04890 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sox12Q04890 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sox12Q04890 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sox12Q04890 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sox12Q04890 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sox12Q04890 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sox12Q04890 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sox12Q04890 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Sox12Q04890 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sox12Q04890 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sox12Q04890 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sox12Q04890 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sox12Q04890 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sox12Q04890 Irf2-209ENSMUST00000210218 535 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sox12Q04890 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sox12Q04890 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sox12Q04890 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sox12Q04890 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sox12Q04890 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sox12Q04890 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sox12Q04890 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sox12Q04890 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sox12Q04890 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sox12Q04890 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sox12Q04890 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sox12Q04890 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sox12Q04890 Gm12813-201ENSMUST00000119615 902 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Sox12Q04890 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Sox12Q04890 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sox12Q04890 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sox12Q04890 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sox12Q04890 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sox12Q04890 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sox12Q04890 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sox12Q04890 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sox12Q04890 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Sox12Q04890 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sox12Q04890 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sox12Q04890 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sox12Q04890 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sox12Q04890 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sox12Q04890 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sox12Q04890 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sox12Q04890 Gm9519-201ENSMUST00000206108 1337 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Sox12Q04890 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms