Protein–RNA interactions for Protein: Q04750

Top1, DNA topoisomerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1Q04750 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Top1Q04750 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Top1Q04750 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Top1Q04750 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Top1Q04750 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Top1Q04750 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Top1Q04750 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Top1Q04750 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Top1Q04750 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Top1Q04750 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Top1Q04750 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Top1Q04750 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Top1Q04750 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Top1Q04750 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Top1Q04750 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Top1Q04750 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Top1Q04750 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Top1Q04750 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Top1Q04750 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Top1Q04750 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Top1Q04750 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Top1Q04750 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Top1Q04750 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Top1Q04750 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Top1Q04750 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Top1Q04750 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Top1Q04750 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Top1Q04750 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Top1Q04750 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Top1Q04750 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Top1Q04750 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Top1Q04750 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Top1Q04750 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Top1Q04750 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Top1Q04750 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Top1Q04750 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Top1Q04750 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Top1Q04750 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Top1Q04750 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Top1Q04750 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Top1Q04750 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Top1Q04750 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Top1Q04750 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Top1Q04750 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Top1Q04750 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Top1Q04750 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Top1Q04750 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Top1Q04750 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Top1Q04750 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Top1Q04750 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Top1Q04750 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Top1Q04750 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Top1Q04750 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Top1Q04750 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Top1Q04750 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Top1Q04750 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Top1Q04750 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Top1Q04750 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Top1Q04750 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Top1Q04750 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Top1Q04750 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Top1Q04750 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Top1Q04750 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Top1Q04750 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Top1Q04750 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Top1Q04750 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Top1Q04750 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Top1Q04750 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Top1Q04750 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Top1Q04750 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Top1Q04750 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Top1Q04750 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Top1Q04750 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Top1Q04750 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Top1Q04750 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Top1Q04750 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Top1Q04750 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Top1Q04750 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Top1Q04750 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Top1Q04750 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Top1Q04750 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Top1Q04750 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Top1Q04750 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Top1Q04750 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Top1Q04750 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Top1Q04750 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Top1Q04750 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Top1Q04750 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Top1Q04750 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Top1Q04750 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Top1Q04750 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Top1Q04750 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Top1Q04750 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Top1Q04750 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Top1Q04750 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Top1Q04750 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Top1Q04750 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Top1Q04750 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Top1Q04750 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Top1Q04750 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms