Protein–RNA interactions for Protein: Q04742

Emx1, Homeobox protein EMX1, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emx1Q04742 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Emx1Q04742 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Emx1Q04742 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Emx1Q04742 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Emx1Q04742 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Emx1Q04742 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Emx1Q04742 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Emx1Q04742 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Emx1Q04742 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Emx1Q04742 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Emx1Q04742 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Emx1Q04742 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Emx1Q04742 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Emx1Q04742 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Emx1Q04742 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Emx1Q04742 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Emx1Q04742 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Emx1Q04742 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Emx1Q04742 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Emx1Q04742 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Emx1Q04742 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Emx1Q04742 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Emx1Q04742 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Emx1Q04742 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Emx1Q04742 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Emx1Q04742 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Emx1Q04742 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Emx1Q04742 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Emx1Q04742 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Emx1Q04742 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Emx1Q04742 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Emx1Q04742 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Emx1Q04742 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Emx1Q04742 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Emx1Q04742 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Emx1Q04742 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Emx1Q04742 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Emx1Q04742 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Emx1Q04742 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Emx1Q04742 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Emx1Q04742 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Emx1Q04742 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Emx1Q04742 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Emx1Q04742 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Emx1Q04742 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Emx1Q04742 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Emx1Q04742 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Emx1Q04742 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Emx1Q04742 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Emx1Q04742 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Emx1Q04742 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Emx1Q04742 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Emx1Q04742 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Emx1Q04742 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Emx1Q04742 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Emx1Q04742 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Emx1Q04742 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Emx1Q04742 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Emx1Q04742 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Emx1Q04742 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Emx1Q04742 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Emx1Q04742 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Emx1Q04742 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Emx1Q04742 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Emx1Q04742 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Emx1Q04742 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Emx1Q04742 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Emx1Q04742 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Emx1Q04742 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Emx1Q04742 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Emx1Q04742 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Emx1Q04742 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Emx1Q04742 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Emx1Q04742 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Emx1Q04742 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Emx1Q04742 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Emx1Q04742 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Emx1Q04742 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Emx1Q04742 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Emx1Q04742 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Emx1Q04742 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Emx1Q04742 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Emx1Q04742 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Emx1Q04742 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Emx1Q04742 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Emx1Q04742 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Emx1Q04742 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Emx1Q04742 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Emx1Q04742 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Emx1Q04742 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Emx1Q04742 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Emx1Q04742 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Emx1Q04742 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Emx1Q04742 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Emx1Q04742 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Emx1Q04742 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Emx1Q04742 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Emx1Q04742 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Emx1Q04742 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Emx1Q04742 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms