Protein–RNA interactions for Protein: Q03719

Kcnd1, Potassium voltage-gated channel subfamily D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnd1Q03719 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Kcnd1Q03719 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Kcnd1Q03719 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Kcnd1Q03719 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Kcnd1Q03719 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Kcnd1Q03719 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Kcnd1Q03719 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Kcnd1Q03719 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Kcnd1Q03719 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Kcnd1Q03719 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Kcnd1Q03719 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Kcnd1Q03719 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Kcnd1Q03719 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Kcnd1Q03719 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Kcnd1Q03719 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kcnd1Q03719 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kcnd1Q03719 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kcnd1Q03719 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kcnd1Q03719 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kcnd1Q03719 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kcnd1Q03719 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kcnd1Q03719 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kcnd1Q03719 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kcnd1Q03719 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Kcnd1Q03719 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kcnd1Q03719 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kcnd1Q03719 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kcnd1Q03719 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kcnd1Q03719 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kcnd1Q03719 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kcnd1Q03719 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kcnd1Q03719 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kcnd1Q03719 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kcnd1Q03719 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Kcnd1Q03719 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kcnd1Q03719 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kcnd1Q03719 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kcnd1Q03719 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kcnd1Q03719 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kcnd1Q03719 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kcnd1Q03719 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kcnd1Q03719 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kcnd1Q03719 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kcnd1Q03719 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kcnd1Q03719 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kcnd1Q03719 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kcnd1Q03719 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kcnd1Q03719 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kcnd1Q03719 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kcnd1Q03719 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kcnd1Q03719 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kcnd1Q03719 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Kcnd1Q03719 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kcnd1Q03719 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kcnd1Q03719 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kcnd1Q03719 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kcnd1Q03719 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kcnd1Q03719 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kcnd1Q03719 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kcnd1Q03719 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kcnd1Q03719 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kcnd1Q03719 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kcnd1Q03719 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kcnd1Q03719 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kcnd1Q03719 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kcnd1Q03719 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kcnd1Q03719 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kcnd1Q03719 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kcnd1Q03719 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kcnd1Q03719 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kcnd1Q03719 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kcnd1Q03719 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kcnd1Q03719 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kcnd1Q03719 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Kcnd1Q03719 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kcnd1Q03719 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kcnd1Q03719 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kcnd1Q03719 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kcnd1Q03719 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kcnd1Q03719 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kcnd1Q03719 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kcnd1Q03719 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kcnd1Q03719 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kcnd1Q03719 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kcnd1Q03719 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kcnd1Q03719 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kcnd1Q03719 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kcnd1Q03719 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kcnd1Q03719 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kcnd1Q03719 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kcnd1Q03719 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kcnd1Q03719 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kcnd1Q03719 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kcnd1Q03719 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kcnd1Q03719 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kcnd1Q03719 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kcnd1Q03719 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kcnd1Q03719 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kcnd1Q03719 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kcnd1Q03719 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms