Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Msx2Q03358 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Msx2Q03358 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Msx2Q03358 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Msx2Q03358 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Msx2Q03358 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Msx2Q03358 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Msx2Q03358 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Msx2Q03358 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Msx2Q03358 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Msx2Q03358 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Msx2Q03358 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Msx2Q03358 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Msx2Q03358 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Msx2Q03358 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Msx2Q03358 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Msx2Q03358 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Msx2Q03358 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Msx2Q03358 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Msx2Q03358 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Msx2Q03358 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Msx2Q03358 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Msx2Q03358 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Msx2Q03358 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Msx2Q03358 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Msx2Q03358 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Msx2Q03358 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Msx2Q03358 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Msx2Q03358 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Msx2Q03358 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Msx2Q03358 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Msx2Q03358 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Msx2Q03358 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Msx2Q03358 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Msx2Q03358 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Msx2Q03358 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Msx2Q03358 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Msx2Q03358 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msx2Q03358 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msx2Q03358 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msx2Q03358 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msx2Q03358 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msx2Q03358 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msx2Q03358 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msx2Q03358 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msx2Q03358 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msx2Q03358 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msx2Q03358 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msx2Q03358 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msx2Q03358 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msx2Q03358 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msx2Q03358 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msx2Q03358 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msx2Q03358 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msx2Q03358 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msx2Q03358 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msx2Q03358 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msx2Q03358 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msx2Q03358 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msx2Q03358 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msx2Q03358 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msx2Q03358 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msx2Q03358 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msx2Q03358 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msx2Q03358 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msx2Q03358 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msx2Q03358 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msx2Q03358 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Msx2Q03358 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msx2Q03358 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msx2Q03358 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msx2Q03358 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msx2Q03358 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msx2Q03358 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msx2Q03358 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msx2Q03358 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msx2Q03358 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msx2Q03358 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msx2Q03358 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msx2Q03358 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msx2Q03358 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msx2Q03358 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Msx2Q03358 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msx2Q03358 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msx2Q03358 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msx2Q03358 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msx2Q03358 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msx2Q03358 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msx2Q03358 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msx2Q03358 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msx2Q03358 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msx2Q03358 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msx2Q03358 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Msx2Q03358 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Msx2Q03358 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Msx2Q03358 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Msx2Q03358 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Msx2Q03358 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Msx2Q03358 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Msx2Q03358 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms