Protein–RNA interactions for Protein: Q03142

Fgfr4, Fibroblast growth factor receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 799 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgfr4Q03142 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Fgfr4Q03142 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Fgfr4Q03142 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Fgfr4Q03142 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Fgfr4Q03142 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Fgfr4Q03142 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Fgfr4Q03142 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fgfr4Q03142 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fgfr4Q03142 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fgfr4Q03142 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fgfr4Q03142 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fgfr4Q03142 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Fgfr4Q03142 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fgfr4Q03142 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fgfr4Q03142 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Fgfr4Q03142 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fgfr4Q03142 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fgfr4Q03142 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fgfr4Q03142 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fgfr4Q03142 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fgfr4Q03142 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fgfr4Q03142 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fgfr4Q03142 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fgfr4Q03142 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fgfr4Q03142 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fgfr4Q03142 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fgfr4Q03142 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fgfr4Q03142 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fgfr4Q03142 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fgfr4Q03142 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fgfr4Q03142 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fgfr4Q03142 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fgfr4Q03142 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fgfr4Q03142 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fgfr4Q03142 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fgfr4Q03142 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fgfr4Q03142 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fgfr4Q03142 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fgfr4Q03142 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fgfr4Q03142 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fgfr4Q03142 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fgfr4Q03142 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fgfr4Q03142 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fgfr4Q03142 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fgfr4Q03142 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fgfr4Q03142 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fgfr4Q03142 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fgfr4Q03142 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Fgfr4Q03142 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Fgfr4Q03142 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Fgfr4Q03142 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Fgfr4Q03142 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Fgfr4Q03142 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Fgfr4Q03142 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Fgfr4Q03142 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Fgfr4Q03142 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Fgfr4Q03142 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Fgfr4Q03142 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Fgfr4Q03142 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Fgfr4Q03142 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Fgfr4Q03142 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Fgfr4Q03142 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Fgfr4Q03142 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Fgfr4Q03142 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Fgfr4Q03142 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Fgfr4Q03142 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Fgfr4Q03142 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Fgfr4Q03142 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fgfr4Q03142 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fgfr4Q03142 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fgfr4Q03142 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fgfr4Q03142 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fgfr4Q03142 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fgfr4Q03142 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fgfr4Q03142 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Fgfr4Q03142 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fgfr4Q03142 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fgfr4Q03142 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fgfr4Q03142 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Fgfr4Q03142 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fgfr4Q03142 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fgfr4Q03142 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fgfr4Q03142 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fgfr4Q03142 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fgfr4Q03142 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fgfr4Q03142 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fgfr4Q03142 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fgfr4Q03142 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fgfr4Q03142 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fgfr4Q03142 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fgfr4Q03142 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fgfr4Q03142 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fgfr4Q03142 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fgfr4Q03142 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fgfr4Q03142 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fgfr4Q03142 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fgfr4Q03142 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fgfr4Q03142 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fgfr4Q03142 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fgfr4Q03142 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms