Protein–RNA interactions for Protein: Q02956

Prkcz, Protein kinase C zeta type, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkczQ02956 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PrkczQ02956 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PrkczQ02956 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PrkczQ02956 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PrkczQ02956 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PrkczQ02956 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PrkczQ02956 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PrkczQ02956 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PrkczQ02956 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PrkczQ02956 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PrkczQ02956 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PrkczQ02956 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PrkczQ02956 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PrkczQ02956 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PrkczQ02956 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PrkczQ02956 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PrkczQ02956 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PrkczQ02956 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PrkczQ02956 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PrkczQ02956 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PrkczQ02956 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PrkczQ02956 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PrkczQ02956 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PrkczQ02956 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PrkczQ02956 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PrkczQ02956 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PrkczQ02956 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PrkczQ02956 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PrkczQ02956 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PrkczQ02956 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PrkczQ02956 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PrkczQ02956 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PrkczQ02956 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PrkczQ02956 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PrkczQ02956 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PrkczQ02956 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PrkczQ02956 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PrkczQ02956 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PrkczQ02956 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PrkczQ02956 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PrkczQ02956 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PrkczQ02956 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PrkczQ02956 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PrkczQ02956 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PrkczQ02956 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PrkczQ02956 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PrkczQ02956 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PrkczQ02956 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PrkczQ02956 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PrkczQ02956 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PrkczQ02956 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PrkczQ02956 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PrkczQ02956 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PrkczQ02956 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PrkczQ02956 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PrkczQ02956 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PrkczQ02956 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PrkczQ02956 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PrkczQ02956 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PrkczQ02956 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PrkczQ02956 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PrkczQ02956 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PrkczQ02956 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PrkczQ02956 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PrkczQ02956 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PrkczQ02956 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PrkczQ02956 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PrkczQ02956 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PrkczQ02956 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PrkczQ02956 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PrkczQ02956 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PrkczQ02956 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PrkczQ02956 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PrkczQ02956 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PrkczQ02956 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PrkczQ02956 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PrkczQ02956 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PrkczQ02956 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PrkczQ02956 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PrkczQ02956 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PrkczQ02956 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PrkczQ02956 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PrkczQ02956 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PrkczQ02956 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PrkczQ02956 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PrkczQ02956 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PrkczQ02956 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PrkczQ02956 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PrkczQ02956 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PrkczQ02956 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PrkczQ02956 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PrkczQ02956 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PrkczQ02956 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PrkczQ02956 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PrkczQ02956 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PrkczQ02956 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PrkczQ02956 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PrkczQ02956 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PrkczQ02956 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PrkczQ02956 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms