Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gjb4Q02738 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gjb4Q02738 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gjb4Q02738 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gjb4Q02738 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gjb4Q02738 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gjb4Q02738 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gjb4Q02738 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gjb4Q02738 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gjb4Q02738 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gjb4Q02738 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gjb4Q02738 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gjb4Q02738 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gjb4Q02738 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gjb4Q02738 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gjb4Q02738 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gjb4Q02738 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gjb4Q02738 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gjb4Q02738 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gjb4Q02738 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gjb4Q02738 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gjb4Q02738 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Gjb4Q02738 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gjb4Q02738 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gjb4Q02738 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gjb4Q02738 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gjb4Q02738 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gjb4Q02738 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gjb4Q02738 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gjb4Q02738 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gjb4Q02738 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gjb4Q02738 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gjb4Q02738 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gjb4Q02738 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gjb4Q02738 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gjb4Q02738 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gjb4Q02738 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gjb4Q02738 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gjb4Q02738 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gjb4Q02738 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gjb4Q02738 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gjb4Q02738 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gjb4Q02738 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gjb4Q02738 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gjb4Q02738 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gjb4Q02738 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gjb4Q02738 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gjb4Q02738 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gjb4Q02738 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gjb4Q02738 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gjb4Q02738 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gjb4Q02738 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gjb4Q02738 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gjb4Q02738 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gjb4Q02738 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gjb4Q02738 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Gjb4Q02738 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gjb4Q02738 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gjb4Q02738 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gjb4Q02738 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gjb4Q02738 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Gjb4Q02738 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gjb4Q02738 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gjb4Q02738 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gjb4Q02738 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gjb4Q02738 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gjb4Q02738 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gjb4Q02738 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gjb4Q02738 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gjb4Q02738 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gjb4Q02738 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gjb4Q02738 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gjb4Q02738 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Gjb4Q02738 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gjb4Q02738 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gjb4Q02738 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gjb4Q02738 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gjb4Q02738 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gjb4Q02738 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gjb4Q02738 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gjb4Q02738 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gjb4Q02738 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gjb4Q02738 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Gjb4Q02738 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Gjb4Q02738 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gjb4Q02738 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gjb4Q02738 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gjb4Q02738 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gjb4Q02738 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gjb4Q02738 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gjb4Q02738 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gjb4Q02738 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gjb4Q02738 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gjb4Q02738 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gjb4Q02738 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gjb4Q02738 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gjb4Q02738 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gjb4Q02738 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gjb4Q02738 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gjb4Q02738 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 215 ms