Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GscQ02591 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GscQ02591 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GscQ02591 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GscQ02591 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GscQ02591 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GscQ02591 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GscQ02591 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GscQ02591 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GscQ02591 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GscQ02591 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GscQ02591 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GscQ02591 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GscQ02591 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GscQ02591 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GscQ02591 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GscQ02591 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GscQ02591 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GscQ02591 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GscQ02591 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GscQ02591 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GscQ02591 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GscQ02591 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GscQ02591 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GscQ02591 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GscQ02591 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GscQ02591 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GscQ02591 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GscQ02591 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GscQ02591 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GscQ02591 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GscQ02591 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GscQ02591 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GscQ02591 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GscQ02591 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GscQ02591 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GscQ02591 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GscQ02591 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GscQ02591 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GscQ02591 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GscQ02591 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GscQ02591 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GscQ02591 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GscQ02591 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GscQ02591 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GscQ02591 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GscQ02591 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GscQ02591 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GscQ02591 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GscQ02591 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GscQ02591 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GscQ02591 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GscQ02591 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GscQ02591 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GscQ02591 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GscQ02591 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GscQ02591 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GscQ02591 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GscQ02591 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GscQ02591 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GscQ02591 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GscQ02591 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GscQ02591 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GscQ02591 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GscQ02591 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GscQ02591 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GscQ02591 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GscQ02591 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GscQ02591 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GscQ02591 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GscQ02591 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GscQ02591 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GscQ02591 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GscQ02591 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GscQ02591 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GscQ02591 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GscQ02591 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GscQ02591 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GscQ02591 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GscQ02591 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GscQ02591 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GscQ02591 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GscQ02591 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GscQ02591 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GscQ02591 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GscQ02591 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GscQ02591 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GscQ02591 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GscQ02591 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GscQ02591 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GscQ02591 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GscQ02591 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GscQ02591 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GscQ02591 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GscQ02591 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GscQ02591 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GscQ02591 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GscQ02591 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GscQ02591 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GscQ02591 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms