Protein–RNA interactions for Protein: Q02576

Nhlh1, Helix-loop-helix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlh1Q02576 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nhlh1Q02576 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nhlh1Q02576 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nhlh1Q02576 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nhlh1Q02576 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nhlh1Q02576 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nhlh1Q02576 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nhlh1Q02576 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Nhlh1Q02576 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nhlh1Q02576 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nhlh1Q02576 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nhlh1Q02576 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nhlh1Q02576 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nhlh1Q02576 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nhlh1Q02576 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nhlh1Q02576 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nhlh1Q02576 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nhlh1Q02576 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nhlh1Q02576 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nhlh1Q02576 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nhlh1Q02576 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nhlh1Q02576 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nhlh1Q02576 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nhlh1Q02576 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nhlh1Q02576 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nhlh1Q02576 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nhlh1Q02576 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Nhlh1Q02576 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nhlh1Q02576 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nhlh1Q02576 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nhlh1Q02576 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nhlh1Q02576 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nhlh1Q02576 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nhlh1Q02576 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nhlh1Q02576 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nhlh1Q02576 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nhlh1Q02576 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nhlh1Q02576 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nhlh1Q02576 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nhlh1Q02576 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nhlh1Q02576 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nhlh1Q02576 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nhlh1Q02576 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nhlh1Q02576 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nhlh1Q02576 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nhlh1Q02576 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nhlh1Q02576 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nhlh1Q02576 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nhlh1Q02576 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nhlh1Q02576 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nhlh1Q02576 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nhlh1Q02576 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nhlh1Q02576 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nhlh1Q02576 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nhlh1Q02576 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nhlh1Q02576 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nhlh1Q02576 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nhlh1Q02576 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nhlh1Q02576 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nhlh1Q02576 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nhlh1Q02576 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nhlh1Q02576 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Nhlh1Q02576 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nhlh1Q02576 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Nhlh1Q02576 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nhlh1Q02576 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nhlh1Q02576 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nhlh1Q02576 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nhlh1Q02576 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nhlh1Q02576 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nhlh1Q02576 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nhlh1Q02576 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nhlh1Q02576 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nhlh1Q02576 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nhlh1Q02576 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nhlh1Q02576 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nhlh1Q02576 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nhlh1Q02576 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nhlh1Q02576 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nhlh1Q02576 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nhlh1Q02576 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Nhlh1Q02576 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nhlh1Q02576 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nhlh1Q02576 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nhlh1Q02576 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nhlh1Q02576 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nhlh1Q02576 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nhlh1Q02576 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nhlh1Q02576 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nhlh1Q02576 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nhlh1Q02576 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nhlh1Q02576 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nhlh1Q02576 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nhlh1Q02576 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nhlh1Q02576 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nhlh1Q02576 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nhlh1Q02576 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nhlh1Q02576 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nhlh1Q02576 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nhlh1Q02576 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms