Protein–RNA interactions for Protein: Q02284

Htr1f, 5-hydroxytryptamine receptor 1F, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htr1fQ02284 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Htr1fQ02284 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Htr1fQ02284 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Htr1fQ02284 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Htr1fQ02284 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Htr1fQ02284 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Htr1fQ02284 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Htr1fQ02284 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Htr1fQ02284 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Htr1fQ02284 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Htr1fQ02284 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Htr1fQ02284 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Htr1fQ02284 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Htr1fQ02284 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Htr1fQ02284 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Htr1fQ02284 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Htr1fQ02284 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Htr1fQ02284 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Htr1fQ02284 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Htr1fQ02284 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Htr1fQ02284 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Htr1fQ02284 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Htr1fQ02284 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Htr1fQ02284 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Htr1fQ02284 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Htr1fQ02284 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Htr1fQ02284 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Htr1fQ02284 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Htr1fQ02284 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Htr1fQ02284 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Htr1fQ02284 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Htr1fQ02284 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Htr1fQ02284 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Htr1fQ02284 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Htr1fQ02284 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Htr1fQ02284 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Htr1fQ02284 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Htr1fQ02284 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Htr1fQ02284 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Htr1fQ02284 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Htr1fQ02284 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Htr1fQ02284 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Htr1fQ02284 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Htr1fQ02284 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Htr1fQ02284 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Htr1fQ02284 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Htr1fQ02284 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Htr1fQ02284 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Htr1fQ02284 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Htr1fQ02284 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Htr1fQ02284 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Htr1fQ02284 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Htr1fQ02284 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Htr1fQ02284 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Htr1fQ02284 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Htr1fQ02284 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Htr1fQ02284 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Htr1fQ02284 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Htr1fQ02284 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Htr1fQ02284 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Htr1fQ02284 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Htr1fQ02284 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Htr1fQ02284 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Htr1fQ02284 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Htr1fQ02284 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Htr1fQ02284 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Htr1fQ02284 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Htr1fQ02284 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Htr1fQ02284 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Htr1fQ02284 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Htr1fQ02284 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Htr1fQ02284 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Htr1fQ02284 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Htr1fQ02284 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Htr1fQ02284 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Htr1fQ02284 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Htr1fQ02284 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Htr1fQ02284 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Htr1fQ02284 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Htr1fQ02284 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Htr1fQ02284 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Htr1fQ02284 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Htr1fQ02284 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Htr1fQ02284 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Htr1fQ02284 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Htr1fQ02284 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Htr1fQ02284 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Htr1fQ02284 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Htr1fQ02284 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Htr1fQ02284 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Htr1fQ02284 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Htr1fQ02284 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Htr1fQ02284 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Htr1fQ02284 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Htr1fQ02284 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Htr1fQ02284 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Htr1fQ02284 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Htr1fQ02284 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Htr1fQ02284 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Htr1fQ02284 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms