Protein–RNA interactions for Protein: Q02111

Prkcq, Protein kinase C theta type, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcqQ02111 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PrkcqQ02111 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PrkcqQ02111 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PrkcqQ02111 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PrkcqQ02111 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PrkcqQ02111 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PrkcqQ02111 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PrkcqQ02111 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PrkcqQ02111 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PrkcqQ02111 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PrkcqQ02111 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PrkcqQ02111 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PrkcqQ02111 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PrkcqQ02111 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PrkcqQ02111 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PrkcqQ02111 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PrkcqQ02111 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PrkcqQ02111 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PrkcqQ02111 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PrkcqQ02111 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PrkcqQ02111 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PrkcqQ02111 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PrkcqQ02111 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PrkcqQ02111 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PrkcqQ02111 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PrkcqQ02111 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PrkcqQ02111 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PrkcqQ02111 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PrkcqQ02111 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PrkcqQ02111 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PrkcqQ02111 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PrkcqQ02111 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PrkcqQ02111 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PrkcqQ02111 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PrkcqQ02111 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PrkcqQ02111 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PrkcqQ02111 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PrkcqQ02111 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PrkcqQ02111 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PrkcqQ02111 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PrkcqQ02111 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PrkcqQ02111 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PrkcqQ02111 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PrkcqQ02111 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PrkcqQ02111 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PrkcqQ02111 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PrkcqQ02111 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PrkcqQ02111 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PrkcqQ02111 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PrkcqQ02111 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PrkcqQ02111 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PrkcqQ02111 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PrkcqQ02111 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PrkcqQ02111 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PrkcqQ02111 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PrkcqQ02111 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PrkcqQ02111 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PrkcqQ02111 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PrkcqQ02111 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PrkcqQ02111 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PrkcqQ02111 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PrkcqQ02111 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PrkcqQ02111 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PrkcqQ02111 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PrkcqQ02111 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PrkcqQ02111 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PrkcqQ02111 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PrkcqQ02111 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PrkcqQ02111 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PrkcqQ02111 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PrkcqQ02111 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PrkcqQ02111 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PrkcqQ02111 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PrkcqQ02111 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PrkcqQ02111 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PrkcqQ02111 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PrkcqQ02111 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PrkcqQ02111 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PrkcqQ02111 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PrkcqQ02111 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PrkcqQ02111 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PrkcqQ02111 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PrkcqQ02111 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PrkcqQ02111 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PrkcqQ02111 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PrkcqQ02111 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PrkcqQ02111 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PrkcqQ02111 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PrkcqQ02111 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PrkcqQ02111 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PrkcqQ02111 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PrkcqQ02111 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PrkcqQ02111 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PrkcqQ02111 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PrkcqQ02111 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PrkcqQ02111 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PrkcqQ02111 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PrkcqQ02111 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PrkcqQ02111 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PrkcqQ02111 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms