Protein–RNA interactions for Protein: Q01887

Ryk, Tyrosine-protein kinase RYK, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RykQ01887 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RykQ01887 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RykQ01887 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RykQ01887 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RykQ01887 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RykQ01887 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RykQ01887 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RykQ01887 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RykQ01887 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RykQ01887 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RykQ01887 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RykQ01887 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RykQ01887 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RykQ01887 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RykQ01887 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RykQ01887 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RykQ01887 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RykQ01887 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RykQ01887 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RykQ01887 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RykQ01887 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RykQ01887 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RykQ01887 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RykQ01887 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RykQ01887 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RykQ01887 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RykQ01887 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RykQ01887 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RykQ01887 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RykQ01887 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RykQ01887 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RykQ01887 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RykQ01887 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RykQ01887 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RykQ01887 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RykQ01887 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RykQ01887 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RykQ01887 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RykQ01887 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RykQ01887 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RykQ01887 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RykQ01887 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RykQ01887 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RykQ01887 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RykQ01887 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RykQ01887 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RykQ01887 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RykQ01887 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RykQ01887 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RykQ01887 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RykQ01887 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RykQ01887 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RykQ01887 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RykQ01887 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RykQ01887 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RykQ01887 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RykQ01887 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RykQ01887 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RykQ01887 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RykQ01887 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RykQ01887 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RykQ01887 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RykQ01887 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RykQ01887 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RykQ01887 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RykQ01887 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RykQ01887 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RykQ01887 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RykQ01887 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RykQ01887 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RykQ01887 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RykQ01887 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RykQ01887 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RykQ01887 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RykQ01887 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RykQ01887 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RykQ01887 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RykQ01887 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RykQ01887 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RykQ01887 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RykQ01887 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RykQ01887 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RykQ01887 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RykQ01887 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RykQ01887 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RykQ01887 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RykQ01887 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RykQ01887 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RykQ01887 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RykQ01887 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RykQ01887 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RykQ01887 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RykQ01887 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RykQ01887 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RykQ01887 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RykQ01887 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RykQ01887 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RykQ01887 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RykQ01887 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RykQ01887 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms