Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EgfrQ01279 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EgfrQ01279 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EgfrQ01279 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
EgfrQ01279 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EgfrQ01279 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EgfrQ01279 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
EgfrQ01279 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EgfrQ01279 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EgfrQ01279 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EgfrQ01279 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
EgfrQ01279 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EgfrQ01279 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EgfrQ01279 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EgfrQ01279 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EgfrQ01279 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
EgfrQ01279 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EgfrQ01279 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
EgfrQ01279 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EgfrQ01279 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
EgfrQ01279 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EgfrQ01279 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EgfrQ01279 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EgfrQ01279 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
EgfrQ01279 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
EgfrQ01279 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
EgfrQ01279 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
EgfrQ01279 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
EgfrQ01279 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
EgfrQ01279 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
EgfrQ01279 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
EgfrQ01279 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
EgfrQ01279 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
EgfrQ01279 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
EgfrQ01279 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
EgfrQ01279 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
EgfrQ01279 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
EgfrQ01279 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
EgfrQ01279 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
EgfrQ01279 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
EgfrQ01279 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
EgfrQ01279 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
EgfrQ01279 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EgfrQ01279 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EgfrQ01279 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EgfrQ01279 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EgfrQ01279 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
EgfrQ01279 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
EgfrQ01279 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
EgfrQ01279 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
EgfrQ01279 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
EgfrQ01279 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
EgfrQ01279 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
EgfrQ01279 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
EgfrQ01279 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
EgfrQ01279 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
EgfrQ01279 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
EgfrQ01279 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
EgfrQ01279 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
EgfrQ01279 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
EgfrQ01279 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
EgfrQ01279 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
EgfrQ01279 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
EgfrQ01279 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EgfrQ01279 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EgfrQ01279 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
EgfrQ01279 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EgfrQ01279 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
EgfrQ01279 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EgfrQ01279 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EgfrQ01279 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EgfrQ01279 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EgfrQ01279 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EgfrQ01279 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
EgfrQ01279 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EgfrQ01279 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
EgfrQ01279 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EgfrQ01279 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
EgfrQ01279 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
EgfrQ01279 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EgfrQ01279 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EgfrQ01279 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EgfrQ01279 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EgfrQ01279 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EgfrQ01279 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EgfrQ01279 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EgfrQ01279 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EgfrQ01279 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EgfrQ01279 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EgfrQ01279 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EgfrQ01279 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EgfrQ01279 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EgfrQ01279 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EgfrQ01279 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
EgfrQ01279 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EgfrQ01279 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
EgfrQ01279 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
EgfrQ01279 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
EgfrQ01279 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
EgfrQ01279 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms