Protein–RNA interactions for Protein: Q01149

Col1a2, Collagen alpha-2(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a2Q01149 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Col1a2Q01149 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Col1a2Q01149 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Col1a2Q01149 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Col1a2Q01149 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Col1a2Q01149 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Col1a2Q01149 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Col1a2Q01149 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Col1a2Q01149 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Col1a2Q01149 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Col1a2Q01149 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Col1a2Q01149 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Col1a2Q01149 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Col1a2Q01149 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Col1a2Q01149 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Col1a2Q01149 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Col1a2Q01149 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Col1a2Q01149 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Col1a2Q01149 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Col1a2Q01149 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Col1a2Q01149 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Col1a2Q01149 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Col1a2Q01149 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Col1a2Q01149 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Col1a2Q01149 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Col1a2Q01149 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Col1a2Q01149 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Col1a2Q01149 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Col1a2Q01149 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Col1a2Q01149 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Col1a2Q01149 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Col1a2Q01149 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Col1a2Q01149 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Col1a2Q01149 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Col1a2Q01149 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Col1a2Q01149 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Col1a2Q01149 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Col1a2Q01149 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Col1a2Q01149 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Col1a2Q01149 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Col1a2Q01149 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Col1a2Q01149 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Col1a2Q01149 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Col1a2Q01149 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Col1a2Q01149 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Col1a2Q01149 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Col1a2Q01149 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Col1a2Q01149 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Col1a2Q01149 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Col1a2Q01149 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Col1a2Q01149 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Col1a2Q01149 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Col1a2Q01149 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Col1a2Q01149 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Col1a2Q01149 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Col1a2Q01149 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Col1a2Q01149 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Col1a2Q01149 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Col1a2Q01149 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Col1a2Q01149 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Col1a2Q01149 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Col1a2Q01149 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Col1a2Q01149 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Col1a2Q01149 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Col1a2Q01149 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Col1a2Q01149 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Col1a2Q01149 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Col1a2Q01149 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Col1a2Q01149 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Col1a2Q01149 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Col1a2Q01149 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Col1a2Q01149 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Col1a2Q01149 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Col1a2Q01149 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Col1a2Q01149 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Col1a2Q01149 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Col1a2Q01149 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Col1a2Q01149 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Col1a2Q01149 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Col1a2Q01149 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Col1a2Q01149 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Col1a2Q01149 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Col1a2Q01149 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Col1a2Q01149 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Col1a2Q01149 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Col1a2Q01149 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Col1a2Q01149 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Col1a2Q01149 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Col1a2Q01149 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Col1a2Q01149 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Col1a2Q01149 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Col1a2Q01149 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Col1a2Q01149 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Col1a2Q01149 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Col1a2Q01149 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Col1a2Q01149 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Col1a2Q01149 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Col1a2Q01149 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Col1a2Q01149 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Col1a2Q01149 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms