Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Grin2bQ01097 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Grin2bQ01097 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Grin2bQ01097 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Grin2bQ01097 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Grin2bQ01097 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Grin2bQ01097 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Grin2bQ01097 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Grin2bQ01097 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Grin2bQ01097 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Grin2bQ01097 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Grin2bQ01097 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Grin2bQ01097 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Grin2bQ01097 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Grin2bQ01097 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Grin2bQ01097 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Grin2bQ01097 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Grin2bQ01097 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Grin2bQ01097 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Grin2bQ01097 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Grin2bQ01097 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Grin2bQ01097 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Grin2bQ01097 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Grin2bQ01097 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Grin2bQ01097 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Grin2bQ01097 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Grin2bQ01097 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Grin2bQ01097 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Grin2bQ01097 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Grin2bQ01097 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Grin2bQ01097 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Grin2bQ01097 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Grin2bQ01097 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Grin2bQ01097 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Grin2bQ01097 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Grin2bQ01097 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Grin2bQ01097 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Grin2bQ01097 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Grin2bQ01097 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Grin2bQ01097 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Grin2bQ01097 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Grin2bQ01097 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Grin2bQ01097 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Grin2bQ01097 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Grin2bQ01097 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Grin2bQ01097 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Grin2bQ01097 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Grin2bQ01097 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Grin2bQ01097 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Grin2bQ01097 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Grin2bQ01097 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Grin2bQ01097 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Grin2bQ01097 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Grin2bQ01097 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Grin2bQ01097 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Grin2bQ01097 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Grin2bQ01097 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Grin2bQ01097 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Grin2bQ01097 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Grin2bQ01097 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Grin2bQ01097 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Grin2bQ01097 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Grin2bQ01097 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Grin2bQ01097 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Grin2bQ01097 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Grin2bQ01097 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Grin2bQ01097 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Grin2bQ01097 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Grin2bQ01097 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Grin2bQ01097 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Grin2bQ01097 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Grin2bQ01097 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Grin2bQ01097 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Grin2bQ01097 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Grin2bQ01097 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Grin2bQ01097 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Grin2bQ01097 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Grin2bQ01097 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Grin2bQ01097 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Grin2bQ01097 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Grin2bQ01097 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Grin2bQ01097 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Grin2bQ01097 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Grin2bQ01097 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Grin2bQ01097 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Grin2bQ01097 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Grin2bQ01097 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Grin2bQ01097 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Grin2bQ01097 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Grin2bQ01097 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Grin2bQ01097 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Grin2bQ01097 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Grin2bQ01097 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Grin2bQ01097 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Grin2bQ01097 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Grin2bQ01097 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Grin2bQ01097 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Grin2bQ01097 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Grin2bQ01097 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Grin2bQ01097 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms