Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
PrcdQ00LT2 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
PrcdQ00LT2 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
PrcdQ00LT2 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PrcdQ00LT2 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PrcdQ00LT2 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PrcdQ00LT2 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PrcdQ00LT2 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
PrcdQ00LT2 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
PrcdQ00LT2 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
PrcdQ00LT2 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PrcdQ00LT2 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PrcdQ00LT2 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PrcdQ00LT2 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PrcdQ00LT2 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PrcdQ00LT2 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
PrcdQ00LT2 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
PrcdQ00LT2 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
PrcdQ00LT2 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PrcdQ00LT2 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PrcdQ00LT2 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PrcdQ00LT2 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PrcdQ00LT2 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PrcdQ00LT2 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PrcdQ00LT2 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PrcdQ00LT2 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PrcdQ00LT2 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
PrcdQ00LT2 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PrcdQ00LT2 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
PrcdQ00LT2 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
PrcdQ00LT2 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PrcdQ00LT2 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PrcdQ00LT2 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PrcdQ00LT2 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PrcdQ00LT2 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PrcdQ00LT2 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
PrcdQ00LT2 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PrcdQ00LT2 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms