Protein–RNA interactions for Protein: Q00915

Rbp1, Retinol-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp1Q00915 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rbp1Q00915 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rbp1Q00915 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rbp1Q00915 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rbp1Q00915 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rbp1Q00915 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rbp1Q00915 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rbp1Q00915 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rbp1Q00915 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rbp1Q00915 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rbp1Q00915 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rbp1Q00915 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rbp1Q00915 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rbp1Q00915 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rbp1Q00915 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rbp1Q00915 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Rbp1Q00915 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rbp1Q00915 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Rbp1Q00915 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rbp1Q00915 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Rbp1Q00915 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Rbp1Q00915 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Rbp1Q00915 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rbp1Q00915 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rbp1Q00915 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rbp1Q00915 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rbp1Q00915 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rbp1Q00915 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rbp1Q00915 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rbp1Q00915 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rbp1Q00915 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rbp1Q00915 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rbp1Q00915 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rbp1Q00915 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rbp1Q00915 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rbp1Q00915 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rbp1Q00915 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rbp1Q00915 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rbp1Q00915 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rbp1Q00915 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rbp1Q00915 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rbp1Q00915 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rbp1Q00915 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rbp1Q00915 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rbp1Q00915 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Rbp1Q00915 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rbp1Q00915 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rbp1Q00915 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rbp1Q00915 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rbp1Q00915 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rbp1Q00915 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rbp1Q00915 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rbp1Q00915 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rbp1Q00915 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rbp1Q00915 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rbp1Q00915 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rbp1Q00915 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rbp1Q00915 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Rbp1Q00915 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rbp1Q00915 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rbp1Q00915 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rbp1Q00915 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Rbp1Q00915 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rbp1Q00915 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rbp1Q00915 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Rbp1Q00915 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rbp1Q00915 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rbp1Q00915 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rbp1Q00915 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rbp1Q00915 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rbp1Q00915 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rbp1Q00915 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rbp1Q00915 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rbp1Q00915 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rbp1Q00915 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rbp1Q00915 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rbp1Q00915 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rbp1Q00915 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rbp1Q00915 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rbp1Q00915 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rbp1Q00915 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rbp1Q00915 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rbp1Q00915 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Rbp1Q00915 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rbp1Q00915 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rbp1Q00915 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rbp1Q00915 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rbp1Q00915 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rbp1Q00915 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rbp1Q00915 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rbp1Q00915 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rbp1Q00915 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rbp1Q00915 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rbp1Q00915 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rbp1Q00915 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rbp1Q00915 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rbp1Q00915 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rbp1Q00915 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rbp1Q00915 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rbp1Q00915 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms