Protein–RNA interactions for Protein: Q00896

Serpina1c, Alpha-1-antitrypsin 1-3, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpina1cQ00896 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Serpina1cQ00896 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Serpina1cQ00896 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Serpina1cQ00896 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Serpina1cQ00896 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Serpina1cQ00896 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Serpina1cQ00896 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Serpina1cQ00896 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Serpina1cQ00896 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Serpina1cQ00896 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Serpina1cQ00896 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Serpina1cQ00896 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Serpina1cQ00896 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Serpina1cQ00896 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Serpina1cQ00896 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Serpina1cQ00896 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Serpina1cQ00896 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Serpina1cQ00896 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Serpina1cQ00896 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Serpina1cQ00896 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Serpina1cQ00896 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Serpina1cQ00896 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Serpina1cQ00896 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Serpina1cQ00896 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Serpina1cQ00896 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Serpina1cQ00896 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Serpina1cQ00896 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Serpina1cQ00896 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Serpina1cQ00896 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Serpina1cQ00896 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Serpina1cQ00896 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Serpina1cQ00896 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Serpina1cQ00896 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Serpina1cQ00896 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Serpina1cQ00896 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Serpina1cQ00896 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Serpina1cQ00896 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Serpina1cQ00896 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Serpina1cQ00896 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Serpina1cQ00896 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Serpina1cQ00896 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Serpina1cQ00896 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Serpina1cQ00896 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Serpina1cQ00896 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Serpina1cQ00896 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Serpina1cQ00896 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Serpina1cQ00896 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Serpina1cQ00896 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Serpina1cQ00896 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Serpina1cQ00896 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Serpina1cQ00896 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Serpina1cQ00896 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Serpina1cQ00896 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Serpina1cQ00896 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Serpina1cQ00896 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Serpina1cQ00896 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Serpina1cQ00896 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Serpina1cQ00896 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Serpina1cQ00896 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Serpina1cQ00896 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Serpina1cQ00896 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Serpina1cQ00896 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Serpina1cQ00896 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Serpina1cQ00896 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Serpina1cQ00896 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Serpina1cQ00896 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Serpina1cQ00896 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Serpina1cQ00896 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Serpina1cQ00896 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Serpina1cQ00896 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Serpina1cQ00896 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Serpina1cQ00896 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Serpina1cQ00896 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Serpina1cQ00896 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Serpina1cQ00896 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Serpina1cQ00896 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Serpina1cQ00896 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Serpina1cQ00896 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Serpina1cQ00896 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Serpina1cQ00896 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Serpina1cQ00896 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Serpina1cQ00896 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Serpina1cQ00896 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Serpina1cQ00896 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Serpina1cQ00896 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Serpina1cQ00896 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Serpina1cQ00896 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Serpina1cQ00896 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Serpina1cQ00896 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Serpina1cQ00896 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Serpina1cQ00896 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Serpina1cQ00896 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Serpina1cQ00896 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Serpina1cQ00896 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Serpina1cQ00896 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Serpina1cQ00896 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Serpina1cQ00896 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Serpina1cQ00896 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Serpina1cQ00896 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Serpina1cQ00896 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms