Protein–RNA interactions for Protein: Q00731

Vegfa, Vascular endothelial growth factor A, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfaQ00731 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VegfaQ00731 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VegfaQ00731 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VegfaQ00731 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VegfaQ00731 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VegfaQ00731 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VegfaQ00731 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VegfaQ00731 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VegfaQ00731 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VegfaQ00731 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VegfaQ00731 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VegfaQ00731 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VegfaQ00731 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VegfaQ00731 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VegfaQ00731 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VegfaQ00731 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VegfaQ00731 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VegfaQ00731 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VegfaQ00731 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VegfaQ00731 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VegfaQ00731 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VegfaQ00731 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
VegfaQ00731 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
VegfaQ00731 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
VegfaQ00731 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VegfaQ00731 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VegfaQ00731 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
VegfaQ00731 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
VegfaQ00731 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
VegfaQ00731 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
VegfaQ00731 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VegfaQ00731 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VegfaQ00731 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VegfaQ00731 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VegfaQ00731 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VegfaQ00731 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
VegfaQ00731 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VegfaQ00731 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VegfaQ00731 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VegfaQ00731 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VegfaQ00731 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VegfaQ00731 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VegfaQ00731 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VegfaQ00731 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VegfaQ00731 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
VegfaQ00731 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VegfaQ00731 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VegfaQ00731 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VegfaQ00731 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VegfaQ00731 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VegfaQ00731 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VegfaQ00731 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VegfaQ00731 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VegfaQ00731 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VegfaQ00731 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VegfaQ00731 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
VegfaQ00731 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VegfaQ00731 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VegfaQ00731 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VegfaQ00731 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VegfaQ00731 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
VegfaQ00731 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VegfaQ00731 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VegfaQ00731 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VegfaQ00731 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VegfaQ00731 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VegfaQ00731 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VegfaQ00731 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VegfaQ00731 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VegfaQ00731 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VegfaQ00731 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VegfaQ00731 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
VegfaQ00731 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VegfaQ00731 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VegfaQ00731 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VegfaQ00731 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
VegfaQ00731 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
VegfaQ00731 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VegfaQ00731 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VegfaQ00731 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VegfaQ00731 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
VegfaQ00731 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VegfaQ00731 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VegfaQ00731 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VegfaQ00731 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VegfaQ00731 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VegfaQ00731 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VegfaQ00731 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VegfaQ00731 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VegfaQ00731 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VegfaQ00731 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VegfaQ00731 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VegfaQ00731 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VegfaQ00731 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VegfaQ00731 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VegfaQ00731 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VegfaQ00731 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VegfaQ00731 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VegfaQ00731 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VegfaQ00731 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms