Protein–RNA interactions for Protein: Q00422

Gabpa, GA-binding protein alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabpaQ00422 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GabpaQ00422 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GabpaQ00422 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GabpaQ00422 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GabpaQ00422 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GabpaQ00422 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GabpaQ00422 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GabpaQ00422 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GabpaQ00422 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GabpaQ00422 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GabpaQ00422 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GabpaQ00422 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GabpaQ00422 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GabpaQ00422 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GabpaQ00422 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GabpaQ00422 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GabpaQ00422 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GabpaQ00422 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GabpaQ00422 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GabpaQ00422 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
GabpaQ00422 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GabpaQ00422 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GabpaQ00422 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GabpaQ00422 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GabpaQ00422 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GabpaQ00422 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GabpaQ00422 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GabpaQ00422 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GabpaQ00422 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GabpaQ00422 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GabpaQ00422 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GabpaQ00422 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GabpaQ00422 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GabpaQ00422 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GabpaQ00422 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GabpaQ00422 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GabpaQ00422 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GabpaQ00422 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
GabpaQ00422 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
GabpaQ00422 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
GabpaQ00422 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GabpaQ00422 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GabpaQ00422 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GabpaQ00422 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GabpaQ00422 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GabpaQ00422 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GabpaQ00422 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GabpaQ00422 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GabpaQ00422 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GabpaQ00422 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GabpaQ00422 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GabpaQ00422 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GabpaQ00422 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
GabpaQ00422 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GabpaQ00422 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GabpaQ00422 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GabpaQ00422 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GabpaQ00422 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GabpaQ00422 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GabpaQ00422 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GabpaQ00422 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GabpaQ00422 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GabpaQ00422 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GabpaQ00422 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GabpaQ00422 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GabpaQ00422 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GabpaQ00422 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GabpaQ00422 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GabpaQ00422 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GabpaQ00422 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GabpaQ00422 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GabpaQ00422 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GabpaQ00422 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GabpaQ00422 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GabpaQ00422 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GabpaQ00422 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GabpaQ00422 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GabpaQ00422 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GabpaQ00422 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GabpaQ00422 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
GabpaQ00422 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GabpaQ00422 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GabpaQ00422 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GabpaQ00422 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GabpaQ00422 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GabpaQ00422 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GabpaQ00422 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GabpaQ00422 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GabpaQ00422 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GabpaQ00422 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GabpaQ00422 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GabpaQ00422 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GabpaQ00422 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GabpaQ00422 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GabpaQ00422 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GabpaQ00422 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
GabpaQ00422 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
GabpaQ00422 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GabpaQ00422 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GabpaQ00422 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms