Protein–RNA interactions for Protein: Q00175

Pgr, Progesterone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PgrQ00175 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PgrQ00175 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PgrQ00175 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PgrQ00175 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PgrQ00175 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PgrQ00175 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PgrQ00175 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PgrQ00175 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PgrQ00175 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PgrQ00175 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PgrQ00175 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PgrQ00175 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PgrQ00175 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PgrQ00175 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PgrQ00175 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PgrQ00175 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PgrQ00175 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PgrQ00175 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PgrQ00175 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PgrQ00175 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PgrQ00175 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PgrQ00175 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PgrQ00175 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PgrQ00175 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PgrQ00175 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PgrQ00175 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PgrQ00175 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PgrQ00175 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PgrQ00175 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PgrQ00175 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PgrQ00175 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PgrQ00175 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PgrQ00175 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PgrQ00175 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PgrQ00175 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PgrQ00175 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PgrQ00175 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PgrQ00175 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PgrQ00175 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PgrQ00175 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PgrQ00175 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PgrQ00175 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PgrQ00175 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PgrQ00175 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PgrQ00175 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PgrQ00175 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PgrQ00175 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PgrQ00175 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PgrQ00175 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PgrQ00175 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PgrQ00175 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PgrQ00175 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PgrQ00175 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PgrQ00175 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PgrQ00175 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PgrQ00175 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PgrQ00175 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PgrQ00175 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PgrQ00175 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PgrQ00175 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PgrQ00175 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PgrQ00175 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PgrQ00175 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PgrQ00175 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PgrQ00175 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PgrQ00175 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PgrQ00175 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PgrQ00175 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PgrQ00175 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PgrQ00175 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PgrQ00175 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PgrQ00175 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PgrQ00175 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PgrQ00175 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PgrQ00175 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PgrQ00175 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PgrQ00175 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PgrQ00175 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PgrQ00175 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PgrQ00175 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PgrQ00175 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PgrQ00175 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PgrQ00175 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PgrQ00175 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PgrQ00175 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PgrQ00175 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PgrQ00175 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PgrQ00175 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PgrQ00175 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PgrQ00175 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PgrQ00175 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PgrQ00175 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PgrQ00175 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PgrQ00175 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PgrQ00175 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PgrQ00175 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PgrQ00175 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PgrQ00175 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PgrQ00175 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PgrQ00175 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms