Protein–RNA interactions for Protein: P97952

Scn1b, Sodium channel subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1bP97952 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scn1bP97952 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scn1bP97952 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scn1bP97952 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scn1bP97952 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scn1bP97952 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Scn1bP97952 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scn1bP97952 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scn1bP97952 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scn1bP97952 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scn1bP97952 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scn1bP97952 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scn1bP97952 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scn1bP97952 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scn1bP97952 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scn1bP97952 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scn1bP97952 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scn1bP97952 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scn1bP97952 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scn1bP97952 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scn1bP97952 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scn1bP97952 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scn1bP97952 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scn1bP97952 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scn1bP97952 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scn1bP97952 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scn1bP97952 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scn1bP97952 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scn1bP97952 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scn1bP97952 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scn1bP97952 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scn1bP97952 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scn1bP97952 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scn1bP97952 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scn1bP97952 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scn1bP97952 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scn1bP97952 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scn1bP97952 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scn1bP97952 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scn1bP97952 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scn1bP97952 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scn1bP97952 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scn1bP97952 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scn1bP97952 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scn1bP97952 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scn1bP97952 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scn1bP97952 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scn1bP97952 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scn1bP97952 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scn1bP97952 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scn1bP97952 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scn1bP97952 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scn1bP97952 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scn1bP97952 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scn1bP97952 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scn1bP97952 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scn1bP97952 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scn1bP97952 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scn1bP97952 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scn1bP97952 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scn1bP97952 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scn1bP97952 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scn1bP97952 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scn1bP97952 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn1bP97952 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn1bP97952 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn1bP97952 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn1bP97952 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn1bP97952 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn1bP97952 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn1bP97952 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn1bP97952 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn1bP97952 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn1bP97952 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn1bP97952 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn1bP97952 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn1bP97952 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn1bP97952 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn1bP97952 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn1bP97952 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn1bP97952 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn1bP97952 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn1bP97952 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn1bP97952 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn1bP97952 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn1bP97952 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scn1bP97952 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scn1bP97952 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scn1bP97952 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scn1bP97952 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scn1bP97952 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scn1bP97952 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scn1bP97952 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scn1bP97952 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scn1bP97952 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scn1bP97952 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scn1bP97952 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scn1bP97952 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scn1bP97952 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scn1bP97952 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms