Protein–RNA interactions for Protein: P97464

Ext1, Exostosin-1, mousemouse

Predictions only

Length 746 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ext1P97464 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ext1P97464 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ext1P97464 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ext1P97464 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ext1P97464 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ext1P97464 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ext1P97464 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ext1P97464 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ext1P97464 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ext1P97464 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ext1P97464 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ext1P97464 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ext1P97464 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ext1P97464 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ext1P97464 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ext1P97464 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ext1P97464 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ext1P97464 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ext1P97464 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ext1P97464 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ext1P97464 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ext1P97464 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ext1P97464 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ext1P97464 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ext1P97464 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ext1P97464 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ext1P97464 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ext1P97464 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ext1P97464 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ext1P97464 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ext1P97464 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ext1P97464 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ext1P97464 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ext1P97464 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ext1P97464 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ext1P97464 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ext1P97464 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ext1P97464 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ext1P97464 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ext1P97464 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ext1P97464 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ext1P97464 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ext1P97464 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ext1P97464 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ext1P97464 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ext1P97464 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ext1P97464 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ext1P97464 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ext1P97464 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ext1P97464 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ext1P97464 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ext1P97464 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ext1P97464 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ext1P97464 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ext1P97464 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ext1P97464 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ext1P97464 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ext1P97464 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ext1P97464 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ext1P97464 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ext1P97464 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ext1P97464 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ext1P97464 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ext1P97464 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ext1P97464 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ext1P97464 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ext1P97464 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ext1P97464 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ext1P97464 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ext1P97464 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ext1P97464 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ext1P97464 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ext1P97464 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ext1P97464 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ext1P97464 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ext1P97464 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ext1P97464 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ext1P97464 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ext1P97464 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ext1P97464 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ext1P97464 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ext1P97464 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ext1P97464 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ext1P97464 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ext1P97464 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ext1P97464 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ext1P97464 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ext1P97464 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ext1P97464 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ext1P97464 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ext1P97464 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ext1P97464 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ext1P97464 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ext1P97464 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ext1P97464 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ext1P97464 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ext1P97464 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ext1P97464 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ext1P97464 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ext1P97464 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms