Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nbr1P97432 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nbr1P97432 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nbr1P97432 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nbr1P97432 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nbr1P97432 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nbr1P97432 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nbr1P97432 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nbr1P97432 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nbr1P97432 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nbr1P97432 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nbr1P97432 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nbr1P97432 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nbr1P97432 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nbr1P97432 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nbr1P97432 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nbr1P97432 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nbr1P97432 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nbr1P97432 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nbr1P97432 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nbr1P97432 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nbr1P97432 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nbr1P97432 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nbr1P97432 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nbr1P97432 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nbr1P97432 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nbr1P97432 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nbr1P97432 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nbr1P97432 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nbr1P97432 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nbr1P97432 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nbr1P97432 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nbr1P97432 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nbr1P97432 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nbr1P97432 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nbr1P97432 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Nbr1P97432 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Nbr1P97432 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nbr1P97432 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nbr1P97432 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nbr1P97432 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nbr1P97432 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nbr1P97432 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nbr1P97432 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nbr1P97432 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nbr1P97432 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nbr1P97432 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nbr1P97432 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nbr1P97432 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nbr1P97432 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nbr1P97432 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nbr1P97432 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nbr1P97432 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nbr1P97432 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nbr1P97432 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nbr1P97432 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nbr1P97432 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nbr1P97432 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nbr1P97432 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nbr1P97432 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nbr1P97432 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Nbr1P97432 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nbr1P97432 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nbr1P97432 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nbr1P97432 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nbr1P97432 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nbr1P97432 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nbr1P97432 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nbr1P97432 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nbr1P97432 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nbr1P97432 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nbr1P97432 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Nbr1P97432 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nbr1P97432 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nbr1P97432 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nbr1P97432 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nbr1P97432 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nbr1P97432 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nbr1P97432 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nbr1P97432 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Nbr1P97432 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nbr1P97432 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nbr1P97432 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Nbr1P97432 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nbr1P97432 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nbr1P97432 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nbr1P97432 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nbr1P97432 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nbr1P97432 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nbr1P97432 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nbr1P97432 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nbr1P97432 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nbr1P97432 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nbr1P97432 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nbr1P97432 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nbr1P97432 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nbr1P97432 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Nbr1P97432 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nbr1P97432 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nbr1P97432 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms