Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cbx1P83917 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cbx1P83917 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cbx1P83917 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cbx1P83917 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cbx1P83917 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cbx1P83917 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Cbx1P83917 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cbx1P83917 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cbx1P83917 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cbx1P83917 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cbx1P83917 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cbx1P83917 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cbx1P83917 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cbx1P83917 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cbx1P83917 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cbx1P83917 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cbx1P83917 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cbx1P83917 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cbx1P83917 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cbx1P83917 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cbx1P83917 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cbx1P83917 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cbx1P83917 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cbx1P83917 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cbx1P83917 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cbx1P83917 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cbx1P83917 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cbx1P83917 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Cbx1P83917 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cbx1P83917 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cbx1P83917 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cbx1P83917 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cbx1P83917 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cbx1P83917 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cbx1P83917 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cbx1P83917 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cbx1P83917 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cbx1P83917 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cbx1P83917 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cbx1P83917 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cbx1P83917 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cbx1P83917 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cbx1P83917 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cbx1P83917 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cbx1P83917 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cbx1P83917 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cbx1P83917 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cbx1P83917 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cbx1P83917 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cbx1P83917 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cbx1P83917 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cbx1P83917 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cbx1P83917 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cbx1P83917 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cbx1P83917 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cbx1P83917 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cbx1P83917 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cbx1P83917 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cbx1P83917 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cbx1P83917 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cbx1P83917 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cbx1P83917 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cbx1P83917 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cbx1P83917 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cbx1P83917 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cbx1P83917 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cbx1P83917 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cbx1P83917 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cbx1P83917 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cbx1P83917 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cbx1P83917 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cbx1P83917 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cbx1P83917 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Cbx1P83917 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cbx1P83917 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cbx1P83917 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cbx1P83917 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cbx1P83917 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cbx1P83917 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cbx1P83917 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cbx1P83917 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cbx1P83917 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cbx1P83917 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cbx1P83917 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cbx1P83917 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cbx1P83917 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cbx1P83917 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cbx1P83917 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cbx1P83917 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cbx1P83917 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cbx1P83917 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cbx1P83917 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cbx1P83917 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cbx1P83917 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cbx1P83917 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Cbx1P83917 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cbx1P83917 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cbx1P83917 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cbx1P83917 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms