Protein–RNA interactions for Protein: P83887

Tubg1, Tubulin gamma-1 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubg1P83887 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Tubg1P83887 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tubg1P83887 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tubg1P83887 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tubg1P83887 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tubg1P83887 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tubg1P83887 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tubg1P83887 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tubg1P83887 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tubg1P83887 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Tubg1P83887 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tubg1P83887 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Tubg1P83887 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tubg1P83887 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tubg1P83887 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tubg1P83887 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tubg1P83887 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tubg1P83887 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tubg1P83887 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tubg1P83887 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tubg1P83887 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tubg1P83887 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tubg1P83887 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Tubg1P83887 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tubg1P83887 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tubg1P83887 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tubg1P83887 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tubg1P83887 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tubg1P83887 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tubg1P83887 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Tubg1P83887 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tubg1P83887 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Tubg1P83887 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tubg1P83887 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tubg1P83887 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tubg1P83887 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tubg1P83887 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tubg1P83887 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tubg1P83887 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tubg1P83887 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tubg1P83887 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tubg1P83887 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tubg1P83887 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tubg1P83887 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.04■□□□□ -0
Tubg1P83887 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tubg1P83887 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tubg1P83887 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tubg1P83887 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tubg1P83887 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tubg1P83887 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Tubg1P83887 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tubg1P83887 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Tubg1P83887 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tubg1P83887 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Tubg1P83887 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Tubg1P83887 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tubg1P83887 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Tubg1P83887 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tubg1P83887 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tubg1P83887 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tubg1P83887 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tubg1P83887 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Tubg1P83887 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tubg1P83887 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tubg1P83887 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tubg1P83887 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tubg1P83887 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tubg1P83887 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tubg1P83887 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tubg1P83887 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tubg1P83887 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tubg1P83887 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tubg1P83887 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tubg1P83887 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tubg1P83887 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tubg1P83887 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Tubg1P83887 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tubg1P83887 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tubg1P83887 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tubg1P83887 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tubg1P83887 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tubg1P83887 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tubg1P83887 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tubg1P83887 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tubg1P83887 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Tubg1P83887 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tubg1P83887 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tubg1P83887 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tubg1P83887 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Tubg1P83887 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tubg1P83887 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Tubg1P83887 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tubg1P83887 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tubg1P83887 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tubg1P83887 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Tubg1P83887 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Tubg1P83887 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Tubg1P83887 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tubg1P83887 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Tubg1P83887 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms