Protein–RNA interactions for Protein: P82347

Sgcd, Delta-sarcoglycan, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcdP82347 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SgcdP82347 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SgcdP82347 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SgcdP82347 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SgcdP82347 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SgcdP82347 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SgcdP82347 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SgcdP82347 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SgcdP82347 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SgcdP82347 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SgcdP82347 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SgcdP82347 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SgcdP82347 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SgcdP82347 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SgcdP82347 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SgcdP82347 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SgcdP82347 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SgcdP82347 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SgcdP82347 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SgcdP82347 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SgcdP82347 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SgcdP82347 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SgcdP82347 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SgcdP82347 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SgcdP82347 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SgcdP82347 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SgcdP82347 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SgcdP82347 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SgcdP82347 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SgcdP82347 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SgcdP82347 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SgcdP82347 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SgcdP82347 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SgcdP82347 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SgcdP82347 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SgcdP82347 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SgcdP82347 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SgcdP82347 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SgcdP82347 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SgcdP82347 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SgcdP82347 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SgcdP82347 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SgcdP82347 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SgcdP82347 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SgcdP82347 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SgcdP82347 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SgcdP82347 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SgcdP82347 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SgcdP82347 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SgcdP82347 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SgcdP82347 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SgcdP82347 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SgcdP82347 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SgcdP82347 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SgcdP82347 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SgcdP82347 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SgcdP82347 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SgcdP82347 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SgcdP82347 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SgcdP82347 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SgcdP82347 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SgcdP82347 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SgcdP82347 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SgcdP82347 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SgcdP82347 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SgcdP82347 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SgcdP82347 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SgcdP82347 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SgcdP82347 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SgcdP82347 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SgcdP82347 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SgcdP82347 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SgcdP82347 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SgcdP82347 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SgcdP82347 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SgcdP82347 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SgcdP82347 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SgcdP82347 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SgcdP82347 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SgcdP82347 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SgcdP82347 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SgcdP82347 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SgcdP82347 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SgcdP82347 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SgcdP82347 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SgcdP82347 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SgcdP82347 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SgcdP82347 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SgcdP82347 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SgcdP82347 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SgcdP82347 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SgcdP82347 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SgcdP82347 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SgcdP82347 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SgcdP82347 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SgcdP82347 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SgcdP82347 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SgcdP82347 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SgcdP82347 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SgcdP82347 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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