Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Otx2P80206 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Otx2P80206 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Otx2P80206 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Otx2P80206 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Otx2P80206 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Otx2P80206 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Otx2P80206 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Otx2P80206 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Otx2P80206 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Otx2P80206 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Otx2P80206 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Otx2P80206 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Otx2P80206 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Otx2P80206 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Otx2P80206 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Otx2P80206 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Otx2P80206 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Otx2P80206 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Otx2P80206 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Otx2P80206 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Otx2P80206 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Otx2P80206 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Otx2P80206 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Otx2P80206 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Otx2P80206 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Otx2P80206 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Otx2P80206 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Otx2P80206 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Otx2P80206 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Otx2P80206 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Otx2P80206 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Otx2P80206 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Otx2P80206 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Otx2P80206 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Otx2P80206 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Otx2P80206 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Otx2P80206 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Otx2P80206 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Otx2P80206 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Otx2P80206 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Otx2P80206 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Otx2P80206 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Otx2P80206 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Otx2P80206 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Otx2P80206 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Otx2P80206 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Otx2P80206 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Otx2P80206 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Otx2P80206 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Otx2P80206 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Otx2P80206 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Otx2P80206 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Otx2P80206 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Otx2P80206 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Otx2P80206 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Otx2P80206 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Otx2P80206 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Otx2P80206 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Otx2P80206 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Otx2P80206 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Otx2P80206 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Otx2P80206 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Otx2P80206 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Otx2P80206 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Otx2P80206 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Otx2P80206 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Otx2P80206 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Otx2P80206 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Otx2P80206 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Otx2P80206 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Otx2P80206 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Otx2P80206 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Otx2P80206 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Otx2P80206 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Otx2P80206 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Otx2P80206 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Otx2P80206 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Otx2P80206 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Otx2P80206 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Otx2P80206 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Otx2P80206 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Otx2P80206 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Otx2P80206 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Otx2P80206 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Otx2P80206 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Otx2P80206 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Otx2P80206 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Otx2P80206 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Otx2P80206 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Otx2P80206 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Otx2P80206 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Otx2P80206 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Otx2P80206 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Otx2P80206 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Otx2P80206 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Otx2P80206 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Otx2P80206 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Otx2P80206 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Otx2P80206 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms