Protein–RNA interactions for Protein: P70700

Polr1b, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1bP70700 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Polr1bP70700 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Polr1bP70700 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Polr1bP70700 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Polr1bP70700 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Polr1bP70700 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Polr1bP70700 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Polr1bP70700 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Polr1bP70700 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Polr1bP70700 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Polr1bP70700 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Polr1bP70700 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Polr1bP70700 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Polr1bP70700 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Polr1bP70700 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Polr1bP70700 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Polr1bP70700 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Polr1bP70700 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Polr1bP70700 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Polr1bP70700 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Polr1bP70700 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Polr1bP70700 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Polr1bP70700 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Polr1bP70700 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Polr1bP70700 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Polr1bP70700 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Polr1bP70700 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Polr1bP70700 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Polr1bP70700 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Polr1bP70700 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Polr1bP70700 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Polr1bP70700 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Polr1bP70700 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Polr1bP70700 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Polr1bP70700 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Polr1bP70700 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Polr1bP70700 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Polr1bP70700 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Polr1bP70700 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Polr1bP70700 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Polr1bP70700 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Polr1bP70700 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Polr1bP70700 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Polr1bP70700 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Polr1bP70700 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Polr1bP70700 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Polr1bP70700 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Polr1bP70700 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Polr1bP70700 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Polr1bP70700 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Polr1bP70700 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Polr1bP70700 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Polr1bP70700 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Polr1bP70700 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Polr1bP70700 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Polr1bP70700 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Polr1bP70700 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Polr1bP70700 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Polr1bP70700 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Polr1bP70700 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Polr1bP70700 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Polr1bP70700 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Polr1bP70700 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Polr1bP70700 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Polr1bP70700 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Polr1bP70700 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Polr1bP70700 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Polr1bP70700 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Polr1bP70700 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Polr1bP70700 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Polr1bP70700 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Polr1bP70700 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Polr1bP70700 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Polr1bP70700 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Polr1bP70700 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Polr1bP70700 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Polr1bP70700 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Polr1bP70700 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Polr1bP70700 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Polr1bP70700 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Polr1bP70700 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Polr1bP70700 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Polr1bP70700 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Polr1bP70700 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Polr1bP70700 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Polr1bP70700 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Polr1bP70700 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Polr1bP70700 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Polr1bP70700 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Polr1bP70700 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Polr1bP70700 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Polr1bP70700 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Polr1bP70700 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Polr1bP70700 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Polr1bP70700 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Polr1bP70700 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Polr1bP70700 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Polr1bP70700 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Polr1bP70700 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Polr1bP70700 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms