Protein–RNA interactions for Protein: P70698

Ctps1, CTP synthase 1, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctps1P70698 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctps1P70698 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctps1P70698 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctps1P70698 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctps1P70698 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctps1P70698 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctps1P70698 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctps1P70698 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctps1P70698 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctps1P70698 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctps1P70698 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctps1P70698 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctps1P70698 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctps1P70698 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctps1P70698 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctps1P70698 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctps1P70698 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctps1P70698 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctps1P70698 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctps1P70698 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctps1P70698 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctps1P70698 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ctps1P70698 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ctps1P70698 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ctps1P70698 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ctps1P70698 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ctps1P70698 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ctps1P70698 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ctps1P70698 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ctps1P70698 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ctps1P70698 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ctps1P70698 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ctps1P70698 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ctps1P70698 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ctps1P70698 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ctps1P70698 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ctps1P70698 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ctps1P70698 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ctps1P70698 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ctps1P70698 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ctps1P70698 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ctps1P70698 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ctps1P70698 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctps1P70698 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctps1P70698 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctps1P70698 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctps1P70698 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctps1P70698 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctps1P70698 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctps1P70698 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctps1P70698 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctps1P70698 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctps1P70698 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctps1P70698 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctps1P70698 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctps1P70698 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctps1P70698 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctps1P70698 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctps1P70698 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctps1P70698 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctps1P70698 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctps1P70698 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctps1P70698 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctps1P70698 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctps1P70698 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctps1P70698 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctps1P70698 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctps1P70698 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctps1P70698 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctps1P70698 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctps1P70698 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctps1P70698 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctps1P70698 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctps1P70698 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctps1P70698 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctps1P70698 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctps1P70698 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctps1P70698 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctps1P70698 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctps1P70698 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctps1P70698 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ctps1P70698 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctps1P70698 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctps1P70698 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctps1P70698 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctps1P70698 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctps1P70698 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctps1P70698 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctps1P70698 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctps1P70698 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctps1P70698 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctps1P70698 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctps1P70698 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctps1P70698 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctps1P70698 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctps1P70698 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctps1P70698 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctps1P70698 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctps1P70698 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ctps1P70698 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms