Protein–RNA interactions for Protein: P70354

Msx3, Homeobox protein MSX-3, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx3P70354 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Msx3P70354 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Msx3P70354 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Msx3P70354 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Msx3P70354 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Msx3P70354 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Msx3P70354 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Msx3P70354 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Msx3P70354 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Msx3P70354 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Msx3P70354 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Msx3P70354 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Msx3P70354 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Msx3P70354 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Msx3P70354 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Msx3P70354 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Msx3P70354 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Msx3P70354 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Msx3P70354 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Msx3P70354 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Msx3P70354 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Msx3P70354 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Msx3P70354 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Msx3P70354 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Msx3P70354 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Msx3P70354 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Msx3P70354 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Msx3P70354 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Msx3P70354 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Msx3P70354 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Msx3P70354 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Msx3P70354 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Msx3P70354 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Msx3P70354 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Msx3P70354 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Msx3P70354 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Msx3P70354 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Msx3P70354 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Msx3P70354 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Msx3P70354 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Msx3P70354 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Msx3P70354 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Msx3P70354 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Msx3P70354 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Msx3P70354 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Msx3P70354 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Msx3P70354 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Msx3P70354 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Msx3P70354 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Msx3P70354 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Msx3P70354 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Msx3P70354 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Msx3P70354 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Msx3P70354 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Msx3P70354 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Msx3P70354 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Msx3P70354 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Msx3P70354 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Msx3P70354 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Msx3P70354 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Msx3P70354 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Msx3P70354 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Msx3P70354 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Msx3P70354 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Msx3P70354 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Msx3P70354 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Msx3P70354 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Msx3P70354 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Msx3P70354 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Msx3P70354 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Msx3P70354 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Msx3P70354 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Msx3P70354 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Msx3P70354 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Msx3P70354 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Msx3P70354 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Msx3P70354 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Msx3P70354 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Msx3P70354 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Msx3P70354 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Msx3P70354 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Msx3P70354 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Msx3P70354 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Msx3P70354 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Msx3P70354 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Msx3P70354 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Msx3P70354 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Msx3P70354 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Msx3P70354 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Msx3P70354 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Msx3P70354 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Msx3P70354 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Msx3P70354 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Msx3P70354 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Msx3P70354 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Msx3P70354 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Msx3P70354 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Msx3P70354 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Msx3P70354 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Msx3P70354 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.9 ms